Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFW7

Cc2d2a, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cc2d2aQ8CFW7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC40.41■■■■■ 4.06
Cc2d2aQ8CFW7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
Cc2d2aQ8CFW7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
Cc2d2aQ8CFW7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
Cc2d2aQ8CFW7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
Cc2d2aQ8CFW7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
Cc2d2aQ8CFW7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC40.38■■■■■ 4.05
Cc2d2aQ8CFW7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
Cc2d2aQ8CFW7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
Cc2d2aQ8CFW7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
Cc2d2aQ8CFW7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
Cc2d2aQ8CFW7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
Cc2d2aQ8CFW7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
Cc2d2aQ8CFW7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
Cc2d2aQ8CFW7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC40.34■■■■■ 4.05
Cc2d2aQ8CFW7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
Cc2d2aQ8CFW7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC40.34■■■■■ 4.05
Cc2d2aQ8CFW7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
Cc2d2aQ8CFW7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
Cc2d2aQ8CFW7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
Cc2d2aQ8CFW7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
Cc2d2aQ8CFW7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
Cc2d2aQ8CFW7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC40.31■■■■■ 4.04
Cc2d2aQ8CFW7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
Cc2d2aQ8CFW7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC40.3■■■■■ 4.04
Cc2d2aQ8CFW7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC40.3■■■■■ 4.04
Cc2d2aQ8CFW7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.29■■■■■ 4.04
Cc2d2aQ8CFW7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC40.29■■■■■ 4.04
Cc2d2aQ8CFW7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
Cc2d2aQ8CFW7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC40.27■■■■■ 4.04
Cc2d2aQ8CFW7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC40.27■■■■■ 4.04
Cc2d2aQ8CFW7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Cc2d2aQ8CFW7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC40.27■■■■■ 4.04
Cc2d2aQ8CFW7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC40.27■■■■■ 4.04
Cc2d2aQ8CFW7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC40.27■■■■■ 4.04
Cc2d2aQ8CFW7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC40.27■■■■■ 4.04
Cc2d2aQ8CFW7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
Cc2d2aQ8CFW7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC40.26■■■■■ 4.04
Cc2d2aQ8CFW7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
Cc2d2aQ8CFW7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
Cc2d2aQ8CFW7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.03
Cc2d2aQ8CFW7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC40.24■■■■■ 4.03
Cc2d2aQ8CFW7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
Cc2d2aQ8CFW7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.23■■■■■ 4.03
Cc2d2aQ8CFW7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
Cc2d2aQ8CFW7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
Cc2d2aQ8CFW7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
Cc2d2aQ8CFW7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC40.21■■■■■ 4.03
Cc2d2aQ8CFW7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
Cc2d2aQ8CFW7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
Cc2d2aQ8CFW7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
Cc2d2aQ8CFW7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
Cc2d2aQ8CFW7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC40.2■■■■■ 4.03
Cc2d2aQ8CFW7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
Cc2d2aQ8CFW7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
Cc2d2aQ8CFW7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
Cc2d2aQ8CFW7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
Cc2d2aQ8CFW7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
Cc2d2aQ8CFW7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
Cc2d2aQ8CFW7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC40.17■■■■■ 4.02
Cc2d2aQ8CFW7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC40.17■■■■■ 4.02
Cc2d2aQ8CFW7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
Cc2d2aQ8CFW7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
Cc2d2aQ8CFW7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
Cc2d2aQ8CFW7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
Cc2d2aQ8CFW7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
Cc2d2aQ8CFW7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
Cc2d2aQ8CFW7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
Cc2d2aQ8CFW7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
Cc2d2aQ8CFW7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
Cc2d2aQ8CFW7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC40.13■■■■■ 4.02
Cc2d2aQ8CFW7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.02
Cc2d2aQ8CFW7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
Cc2d2aQ8CFW7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.01
Cc2d2aQ8CFW7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
Cc2d2aQ8CFW7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
Cc2d2aQ8CFW7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
Cc2d2aQ8CFW7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.11■■■■■ 4.01
Cc2d2aQ8CFW7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
Cc2d2aQ8CFW7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
Cc2d2aQ8CFW7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
Cc2d2aQ8CFW7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
Cc2d2aQ8CFW7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC40.08■■■■■ 4.01
Cc2d2aQ8CFW7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4.01
Cc2d2aQ8CFW7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4.01
Cc2d2aQ8CFW7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4
Cc2d2aQ8CFW7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC40.06■■■■■ 4
Cc2d2aQ8CFW7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
Cc2d2aQ8CFW7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.05■■■■■ 4
Cc2d2aQ8CFW7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.05■■■■■ 4
Cc2d2aQ8CFW7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
Cc2d2aQ8CFW7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
Cc2d2aQ8CFW7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.03■■■■■ 4
Cc2d2aQ8CFW7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
Cc2d2aQ8CFW7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
Cc2d2aQ8CFW7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
Cc2d2aQ8CFW7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
Cc2d2aQ8CFW7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
Cc2d2aQ8CFW7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
Cc2d2aQ8CFW7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms