Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Hpf1Q8CFE2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hpf1Q8CFE2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hpf1Q8CFE2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Hpf1Q8CFE2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hpf1Q8CFE2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hpf1Q8CFE2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hpf1Q8CFE2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hpf1Q8CFE2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hpf1Q8CFE2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hpf1Q8CFE2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hpf1Q8CFE2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hpf1Q8CFE2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hpf1Q8CFE2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hpf1Q8CFE2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hpf1Q8CFE2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hpf1Q8CFE2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hpf1Q8CFE2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Hpf1Q8CFE2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Hpf1Q8CFE2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Hpf1Q8CFE2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hpf1Q8CFE2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hpf1Q8CFE2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hpf1Q8CFE2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hpf1Q8CFE2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hpf1Q8CFE2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hpf1Q8CFE2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hpf1Q8CFE2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hpf1Q8CFE2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hpf1Q8CFE2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hpf1Q8CFE2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hpf1Q8CFE2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hpf1Q8CFE2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hpf1Q8CFE2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hpf1Q8CFE2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hpf1Q8CFE2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hpf1Q8CFE2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hpf1Q8CFE2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hpf1Q8CFE2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hpf1Q8CFE2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hpf1Q8CFE2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hpf1Q8CFE2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hpf1Q8CFE2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hpf1Q8CFE2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hpf1Q8CFE2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hpf1Q8CFE2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Hpf1Q8CFE2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Hpf1Q8CFE2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hpf1Q8CFE2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hpf1Q8CFE2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hpf1Q8CFE2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hpf1Q8CFE2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hpf1Q8CFE2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hpf1Q8CFE2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hpf1Q8CFE2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hpf1Q8CFE2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hpf1Q8CFE2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Hpf1Q8CFE2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hpf1Q8CFE2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hpf1Q8CFE2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hpf1Q8CFE2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Hpf1Q8CFE2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Hpf1Q8CFE2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hpf1Q8CFE2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hpf1Q8CFE2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Hpf1Q8CFE2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Hpf1Q8CFE2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hpf1Q8CFE2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hpf1Q8CFE2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hpf1Q8CFE2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hpf1Q8CFE2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hpf1Q8CFE2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Hpf1Q8CFE2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hpf1Q8CFE2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hpf1Q8CFE2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hpf1Q8CFE2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hpf1Q8CFE2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hpf1Q8CFE2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hpf1Q8CFE2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hpf1Q8CFE2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hpf1Q8CFE2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hpf1Q8CFE2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hpf1Q8CFE2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hpf1Q8CFE2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hpf1Q8CFE2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hpf1Q8CFE2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hpf1Q8CFE2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hpf1Q8CFE2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hpf1Q8CFE2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hpf1Q8CFE2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hpf1Q8CFE2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hpf1Q8CFE2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hpf1Q8CFE2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hpf1Q8CFE2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hpf1Q8CFE2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hpf1Q8CFE2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hpf1Q8CFE2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hpf1Q8CFE2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hpf1Q8CFE2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hpf1Q8CFE2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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