Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdkl1Q8CEQ0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdkl1Q8CEQ0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdkl1Q8CEQ0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdkl1Q8CEQ0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdkl1Q8CEQ0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdkl1Q8CEQ0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdkl1Q8CEQ0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdkl1Q8CEQ0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdkl1Q8CEQ0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdkl1Q8CEQ0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdkl1Q8CEQ0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdkl1Q8CEQ0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdkl1Q8CEQ0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdkl1Q8CEQ0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdkl1Q8CEQ0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdkl1Q8CEQ0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdkl1Q8CEQ0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdkl1Q8CEQ0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdkl1Q8CEQ0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdkl1Q8CEQ0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdkl1Q8CEQ0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdkl1Q8CEQ0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdkl1Q8CEQ0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdkl1Q8CEQ0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdkl1Q8CEQ0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdkl1Q8CEQ0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdkl1Q8CEQ0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdkl1Q8CEQ0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdkl1Q8CEQ0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdkl1Q8CEQ0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdkl1Q8CEQ0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdkl1Q8CEQ0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdkl1Q8CEQ0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdkl1Q8CEQ0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdkl1Q8CEQ0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdkl1Q8CEQ0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdkl1Q8CEQ0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdkl1Q8CEQ0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdkl1Q8CEQ0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdkl1Q8CEQ0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdkl1Q8CEQ0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdkl1Q8CEQ0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdkl1Q8CEQ0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdkl1Q8CEQ0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdkl1Q8CEQ0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdkl1Q8CEQ0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdkl1Q8CEQ0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdkl1Q8CEQ0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdkl1Q8CEQ0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdkl1Q8CEQ0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdkl1Q8CEQ0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdkl1Q8CEQ0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdkl1Q8CEQ0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdkl1Q8CEQ0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cdkl1Q8CEQ0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cdkl1Q8CEQ0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Cdkl1Q8CEQ0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cdkl1Q8CEQ0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdkl1Q8CEQ0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cdkl1Q8CEQ0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdkl1Q8CEQ0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdkl1Q8CEQ0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdkl1Q8CEQ0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cdkl1Q8CEQ0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdkl1Q8CEQ0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdkl1Q8CEQ0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Cdkl1Q8CEQ0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdkl1Q8CEQ0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdkl1Q8CEQ0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdkl1Q8CEQ0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdkl1Q8CEQ0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdkl1Q8CEQ0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cdkl1Q8CEQ0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdkl1Q8CEQ0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cdkl1Q8CEQ0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cdkl1Q8CEQ0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdkl1Q8CEQ0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cdkl1Q8CEQ0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdkl1Q8CEQ0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdkl1Q8CEQ0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdkl1Q8CEQ0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdkl1Q8CEQ0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdkl1Q8CEQ0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdkl1Q8CEQ0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdkl1Q8CEQ0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdkl1Q8CEQ0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdkl1Q8CEQ0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdkl1Q8CEQ0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms