Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC5

Nkiras1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkiras1Q8CEC5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nkiras1Q8CEC5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nkiras1Q8CEC5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nkiras1Q8CEC5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nkiras1Q8CEC5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nkiras1Q8CEC5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nkiras1Q8CEC5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nkiras1Q8CEC5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nkiras1Q8CEC5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nkiras1Q8CEC5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nkiras1Q8CEC5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nkiras1Q8CEC5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nkiras1Q8CEC5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nkiras1Q8CEC5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nkiras1Q8CEC5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Nkiras1Q8CEC5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nkiras1Q8CEC5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nkiras1Q8CEC5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nkiras1Q8CEC5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nkiras1Q8CEC5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nkiras1Q8CEC5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nkiras1Q8CEC5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nkiras1Q8CEC5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nkiras1Q8CEC5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nkiras1Q8CEC5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Nkiras1Q8CEC5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nkiras1Q8CEC5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nkiras1Q8CEC5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nkiras1Q8CEC5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nkiras1Q8CEC5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nkiras1Q8CEC5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nkiras1Q8CEC5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Nkiras1Q8CEC5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nkiras1Q8CEC5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nkiras1Q8CEC5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nkiras1Q8CEC5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nkiras1Q8CEC5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nkiras1Q8CEC5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nkiras1Q8CEC5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nkiras1Q8CEC5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nkiras1Q8CEC5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nkiras1Q8CEC5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nkiras1Q8CEC5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nkiras1Q8CEC5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nkiras1Q8CEC5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Nkiras1Q8CEC5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nkiras1Q8CEC5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nkiras1Q8CEC5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nkiras1Q8CEC5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nkiras1Q8CEC5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nkiras1Q8CEC5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nkiras1Q8CEC5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nkiras1Q8CEC5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nkiras1Q8CEC5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nkiras1Q8CEC5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Nkiras1Q8CEC5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nkiras1Q8CEC5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nkiras1Q8CEC5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nkiras1Q8CEC5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Nkiras1Q8CEC5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nkiras1Q8CEC5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nkiras1Q8CEC5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nkiras1Q8CEC5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nkiras1Q8CEC5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nkiras1Q8CEC5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nkiras1Q8CEC5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nkiras1Q8CEC5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkiras1Q8CEC5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkiras1Q8CEC5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkiras1Q8CEC5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkiras1Q8CEC5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkiras1Q8CEC5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkiras1Q8CEC5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkiras1Q8CEC5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkiras1Q8CEC5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nkiras1Q8CEC5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nkiras1Q8CEC5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nkiras1Q8CEC5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nkiras1Q8CEC5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nkiras1Q8CEC5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nkiras1Q8CEC5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nkiras1Q8CEC5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nkiras1Q8CEC5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nkiras1Q8CEC5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nkiras1Q8CEC5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nkiras1Q8CEC5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nkiras1Q8CEC5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nkiras1Q8CEC5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Nkiras1Q8CEC5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nkiras1Q8CEC5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Nkiras1Q8CEC5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nkiras1Q8CEC5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nkiras1Q8CEC5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nkiras1Q8CEC5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nkiras1Q8CEC5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nkiras1Q8CEC5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nkiras1Q8CEC5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nkiras1Q8CEC5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nkiras1Q8CEC5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nkiras1Q8CEC5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms