Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Nup88Q8CEC0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nup88Q8CEC0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nup88Q8CEC0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nup88Q8CEC0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nup88Q8CEC0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Nup88Q8CEC0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nup88Q8CEC0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Nup88Q8CEC0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nup88Q8CEC0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nup88Q8CEC0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nup88Q8CEC0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nup88Q8CEC0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nup88Q8CEC0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nup88Q8CEC0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nup88Q8CEC0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nup88Q8CEC0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nup88Q8CEC0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nup88Q8CEC0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nup88Q8CEC0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nup88Q8CEC0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Nup88Q8CEC0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nup88Q8CEC0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Nup88Q8CEC0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nup88Q8CEC0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nup88Q8CEC0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nup88Q8CEC0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Nup88Q8CEC0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nup88Q8CEC0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nup88Q8CEC0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Nup88Q8CEC0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nup88Q8CEC0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nup88Q8CEC0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nup88Q8CEC0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Nup88Q8CEC0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Nup88Q8CEC0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nup88Q8CEC0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nup88Q8CEC0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Nup88Q8CEC0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Nup88Q8CEC0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nup88Q8CEC0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nup88Q8CEC0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nup88Q8CEC0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nup88Q8CEC0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nup88Q8CEC0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nup88Q8CEC0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nup88Q8CEC0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nup88Q8CEC0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nup88Q8CEC0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nup88Q8CEC0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Nup88Q8CEC0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nup88Q8CEC0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nup88Q8CEC0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nup88Q8CEC0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nup88Q8CEC0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nup88Q8CEC0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nup88Q8CEC0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nup88Q8CEC0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nup88Q8CEC0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nup88Q8CEC0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nup88Q8CEC0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nup88Q8CEC0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nup88Q8CEC0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nup88Q8CEC0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nup88Q8CEC0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Nup88Q8CEC0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nup88Q8CEC0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nup88Q8CEC0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nup88Q8CEC0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nup88Q8CEC0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nup88Q8CEC0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nup88Q8CEC0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nup88Q8CEC0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nup88Q8CEC0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nup88Q8CEC0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nup88Q8CEC0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nup88Q8CEC0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nup88Q8CEC0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nup88Q8CEC0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nup88Q8CEC0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nup88Q8CEC0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Nup88Q8CEC0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nup88Q8CEC0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nup88Q8CEC0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nup88Q8CEC0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Nup88Q8CEC0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nup88Q8CEC0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nup88Q8CEC0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nup88Q8CEC0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nup88Q8CEC0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nup88Q8CEC0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nup88Q8CEC0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nup88Q8CEC0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nup88Q8CEC0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nup88Q8CEC0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nup88Q8CEC0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nup88Q8CEC0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nup88Q8CEC0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nup88Q8CEC0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nup88Q8CEC0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms