Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc17Q8CE13 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc17Q8CE13 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc17Q8CE13 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc17Q8CE13 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc17Q8CE13 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc17Q8CE13 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc17Q8CE13 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc17Q8CE13 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc17Q8CE13 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc17Q8CE13 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc17Q8CE13 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc17Q8CE13 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc17Q8CE13 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc17Q8CE13 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc17Q8CE13 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc17Q8CE13 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc17Q8CE13 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc17Q8CE13 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc17Q8CE13 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc17Q8CE13 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc17Q8CE13 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc17Q8CE13 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc17Q8CE13 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc17Q8CE13 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc17Q8CE13 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc17Q8CE13 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc17Q8CE13 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc17Q8CE13 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc17Q8CE13 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc17Q8CE13 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc17Q8CE13 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc17Q8CE13 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc17Q8CE13 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc17Q8CE13 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc17Q8CE13 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc17Q8CE13 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc17Q8CE13 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc17Q8CE13 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc17Q8CE13 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc17Q8CE13 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc17Q8CE13 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc17Q8CE13 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc17Q8CE13 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc17Q8CE13 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc17Q8CE13 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc17Q8CE13 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc17Q8CE13 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc17Q8CE13 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc17Q8CE13 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc17Q8CE13 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc17Q8CE13 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc17Q8CE13 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc17Q8CE13 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc17Q8CE13 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc17Q8CE13 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc17Q8CE13 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc17Q8CE13 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc17Q8CE13 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc17Q8CE13 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc17Q8CE13 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc17Q8CE13 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc17Q8CE13 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc17Q8CE13 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc17Q8CE13 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc17Q8CE13 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc17Q8CE13 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc17Q8CE13 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc17Q8CE13 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc17Q8CE13 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc17Q8CE13 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc17Q8CE13 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc17Q8CE13 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc17Q8CE13 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc17Q8CE13 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc17Q8CE13 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc17Q8CE13 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc17Q8CE13 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc17Q8CE13 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc17Q8CE13 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc17Q8CE13 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc17Q8CE13 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc17Q8CE13 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc17Q8CE13 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc17Q8CE13 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc17Q8CE13 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc17Q8CE13 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc17Q8CE13 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc17Q8CE13 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc17Q8CE13 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc17Q8CE13 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc17Q8CE13 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc17Q8CE13 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc17Q8CE13 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc17Q8CE13 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc17Q8CE13 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc17Q8CE13 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc17Q8CE13 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc17Q8CE13 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc17Q8CE13 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms