Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc63Q8CDV6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc63Q8CDV6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc63Q8CDV6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc63Q8CDV6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc63Q8CDV6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc63Q8CDV6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc63Q8CDV6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc63Q8CDV6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc63Q8CDV6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc63Q8CDV6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc63Q8CDV6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc63Q8CDV6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc63Q8CDV6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc63Q8CDV6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc63Q8CDV6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc63Q8CDV6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc63Q8CDV6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc63Q8CDV6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc63Q8CDV6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc63Q8CDV6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc63Q8CDV6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc63Q8CDV6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc63Q8CDV6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc63Q8CDV6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc63Q8CDV6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc63Q8CDV6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc63Q8CDV6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc63Q8CDV6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc63Q8CDV6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc63Q8CDV6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc63Q8CDV6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc63Q8CDV6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc63Q8CDV6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc63Q8CDV6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc63Q8CDV6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc63Q8CDV6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc63Q8CDV6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc63Q8CDV6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc63Q8CDV6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc63Q8CDV6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc63Q8CDV6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc63Q8CDV6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc63Q8CDV6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc63Q8CDV6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc63Q8CDV6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc63Q8CDV6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc63Q8CDV6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc63Q8CDV6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc63Q8CDV6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc63Q8CDV6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc63Q8CDV6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc63Q8CDV6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc63Q8CDV6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc63Q8CDV6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc63Q8CDV6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc63Q8CDV6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc63Q8CDV6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc63Q8CDV6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc63Q8CDV6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc63Q8CDV6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc63Q8CDV6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc63Q8CDV6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc63Q8CDV6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc63Q8CDV6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc63Q8CDV6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc63Q8CDV6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc63Q8CDV6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc63Q8CDV6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc63Q8CDV6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc63Q8CDV6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc63Q8CDV6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc63Q8CDV6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc63Q8CDV6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc63Q8CDV6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc63Q8CDV6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc63Q8CDV6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc63Q8CDV6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc63Q8CDV6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc63Q8CDV6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc63Q8CDV6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc63Q8CDV6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc63Q8CDV6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc63Q8CDV6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc63Q8CDV6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc63Q8CDV6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc63Q8CDV6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc63Q8CDV6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc63Q8CDV6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc63Q8CDV6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc63Q8CDV6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc63Q8CDV6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc63Q8CDV6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc63Q8CDV6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc63Q8CDV6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc63Q8CDV6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc63Q8CDV6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc63Q8CDV6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc63Q8CDV6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc63Q8CDV6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 271.3 ms