Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCX5

Krt222, Keratin-like protein KRT222, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt222Q8CCX5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt222Q8CCX5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt222Q8CCX5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt222Q8CCX5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt222Q8CCX5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt222Q8CCX5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt222Q8CCX5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt222Q8CCX5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt222Q8CCX5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt222Q8CCX5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt222Q8CCX5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Krt222Q8CCX5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Krt222Q8CCX5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Krt222Q8CCX5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Krt222Q8CCX5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Krt222Q8CCX5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt222Q8CCX5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt222Q8CCX5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt222Q8CCX5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt222Q8CCX5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt222Q8CCX5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt222Q8CCX5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt222Q8CCX5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt222Q8CCX5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt222Q8CCX5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt222Q8CCX5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt222Q8CCX5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt222Q8CCX5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt222Q8CCX5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt222Q8CCX5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt222Q8CCX5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt222Q8CCX5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt222Q8CCX5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt222Q8CCX5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt222Q8CCX5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt222Q8CCX5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt222Q8CCX5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt222Q8CCX5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt222Q8CCX5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Krt222Q8CCX5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Krt222Q8CCX5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Krt222Q8CCX5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Krt222Q8CCX5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt222Q8CCX5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt222Q8CCX5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt222Q8CCX5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt222Q8CCX5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt222Q8CCX5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt222Q8CCX5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt222Q8CCX5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt222Q8CCX5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt222Q8CCX5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt222Q8CCX5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt222Q8CCX5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt222Q8CCX5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt222Q8CCX5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt222Q8CCX5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt222Q8CCX5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt222Q8CCX5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt222Q8CCX5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt222Q8CCX5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt222Q8CCX5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt222Q8CCX5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt222Q8CCX5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt222Q8CCX5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt222Q8CCX5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt222Q8CCX5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt222Q8CCX5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt222Q8CCX5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt222Q8CCX5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt222Q8CCX5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt222Q8CCX5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt222Q8CCX5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt222Q8CCX5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt222Q8CCX5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt222Q8CCX5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt222Q8CCX5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt222Q8CCX5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt222Q8CCX5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt222Q8CCX5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt222Q8CCX5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt222Q8CCX5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt222Q8CCX5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt222Q8CCX5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt222Q8CCX5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt222Q8CCX5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt222Q8CCX5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt222Q8CCX5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt222Q8CCX5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt222Q8CCX5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt222Q8CCX5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt222Q8CCX5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt222Q8CCX5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt222Q8CCX5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt222Q8CCX5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt222Q8CCX5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt222Q8CCX5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt222Q8CCX5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt222Q8CCX5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt222Q8CCX5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms