Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCC3

Uncharacterized protein C12orf56 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CCC3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q8CCC3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q8CCC3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q8CCC3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q8CCC3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Q8CCC3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Q8CCC3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Q8CCC3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Q8CCC3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Q8CCC3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q8CCC3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q8CCC3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q8CCC3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q8CCC3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q8CCC3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q8CCC3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q8CCC3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q8CCC3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q8CCC3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q8CCC3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q8CCC3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q8CCC3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q8CCC3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q8CCC3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q8CCC3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q8CCC3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q8CCC3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q8CCC3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q8CCC3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q8CCC3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q8CCC3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q8CCC3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q8CCC3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q8CCC3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q8CCC3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q8CCC3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q8CCC3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Q8CCC3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q8CCC3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q8CCC3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q8CCC3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q8CCC3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Q8CCC3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q8CCC3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q8CCC3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q8CCC3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q8CCC3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q8CCC3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q8CCC3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q8CCC3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q8CCC3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q8CCC3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q8CCC3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q8CCC3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q8CCC3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q8CCC3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q8CCC3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Q8CCC3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q8CCC3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q8CCC3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q8CCC3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q8CCC3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q8CCC3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q8CCC3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Q8CCC3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Q8CCC3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q8CCC3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q8CCC3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q8CCC3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q8CCC3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q8CCC3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q8CCC3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q8CCC3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q8CCC3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q8CCC3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q8CCC3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Q8CCC3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Q8CCC3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q8CCC3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q8CCC3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q8CCC3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q8CCC3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q8CCC3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q8CCC3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q8CCC3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q8CCC3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q8CCC3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q8CCC3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q8CCC3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q8CCC3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q8CCC3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q8CCC3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q8CCC3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q8CCC3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q8CCC3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q8CCC3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q8CCC3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q8CCC3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q8CCC3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q8CCC3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms