Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nrip1Q8CBD1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nrip1Q8CBD1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nrip1Q8CBD1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Nrip1Q8CBD1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nrip1Q8CBD1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nrip1Q8CBD1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nrip1Q8CBD1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nrip1Q8CBD1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nrip1Q8CBD1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nrip1Q8CBD1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nrip1Q8CBD1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nrip1Q8CBD1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Nrip1Q8CBD1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nrip1Q8CBD1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nrip1Q8CBD1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nrip1Q8CBD1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nrip1Q8CBD1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Nrip1Q8CBD1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nrip1Q8CBD1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nrip1Q8CBD1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nrip1Q8CBD1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nrip1Q8CBD1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nrip1Q8CBD1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nrip1Q8CBD1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nrip1Q8CBD1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nrip1Q8CBD1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nrip1Q8CBD1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nrip1Q8CBD1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nrip1Q8CBD1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nrip1Q8CBD1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nrip1Q8CBD1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nrip1Q8CBD1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nrip1Q8CBD1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nrip1Q8CBD1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nrip1Q8CBD1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nrip1Q8CBD1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Nrip1Q8CBD1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nrip1Q8CBD1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nrip1Q8CBD1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nrip1Q8CBD1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nrip1Q8CBD1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nrip1Q8CBD1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nrip1Q8CBD1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nrip1Q8CBD1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Nrip1Q8CBD1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nrip1Q8CBD1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nrip1Q8CBD1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nrip1Q8CBD1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nrip1Q8CBD1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nrip1Q8CBD1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nrip1Q8CBD1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nrip1Q8CBD1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nrip1Q8CBD1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Nrip1Q8CBD1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nrip1Q8CBD1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nrip1Q8CBD1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Nrip1Q8CBD1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nrip1Q8CBD1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nrip1Q8CBD1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nrip1Q8CBD1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nrip1Q8CBD1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nrip1Q8CBD1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nrip1Q8CBD1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nrip1Q8CBD1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nrip1Q8CBD1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nrip1Q8CBD1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nrip1Q8CBD1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nrip1Q8CBD1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nrip1Q8CBD1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nrip1Q8CBD1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nrip1Q8CBD1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nrip1Q8CBD1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nrip1Q8CBD1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nrip1Q8CBD1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nrip1Q8CBD1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nrip1Q8CBD1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nrip1Q8CBD1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nrip1Q8CBD1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nrip1Q8CBD1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nrip1Q8CBD1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nrip1Q8CBD1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nrip1Q8CBD1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nrip1Q8CBD1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nrip1Q8CBD1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nrip1Q8CBD1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Nrip1Q8CBD1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nrip1Q8CBD1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nrip1Q8CBD1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nrip1Q8CBD1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nrip1Q8CBD1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nrip1Q8CBD1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nrip1Q8CBD1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nrip1Q8CBD1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nrip1Q8CBD1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nrip1Q8CBD1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nrip1Q8CBD1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nrip1Q8CBD1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nrip1Q8CBD1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nrip1Q8CBD1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.2 ms