Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FarsaQ8C0C7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FarsaQ8C0C7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FarsaQ8C0C7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FarsaQ8C0C7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FarsaQ8C0C7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FarsaQ8C0C7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FarsaQ8C0C7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FarsaQ8C0C7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FarsaQ8C0C7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FarsaQ8C0C7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FarsaQ8C0C7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FarsaQ8C0C7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FarsaQ8C0C7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FarsaQ8C0C7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FarsaQ8C0C7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FarsaQ8C0C7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FarsaQ8C0C7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FarsaQ8C0C7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FarsaQ8C0C7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FarsaQ8C0C7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FarsaQ8C0C7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FarsaQ8C0C7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FarsaQ8C0C7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FarsaQ8C0C7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FarsaQ8C0C7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FarsaQ8C0C7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FarsaQ8C0C7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FarsaQ8C0C7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FarsaQ8C0C7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FarsaQ8C0C7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FarsaQ8C0C7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FarsaQ8C0C7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FarsaQ8C0C7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FarsaQ8C0C7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FarsaQ8C0C7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FarsaQ8C0C7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FarsaQ8C0C7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FarsaQ8C0C7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FarsaQ8C0C7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FarsaQ8C0C7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FarsaQ8C0C7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FarsaQ8C0C7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FarsaQ8C0C7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FarsaQ8C0C7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FarsaQ8C0C7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FarsaQ8C0C7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FarsaQ8C0C7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FarsaQ8C0C7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FarsaQ8C0C7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FarsaQ8C0C7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FarsaQ8C0C7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
FarsaQ8C0C7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FarsaQ8C0C7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FarsaQ8C0C7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FarsaQ8C0C7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FarsaQ8C0C7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
FarsaQ8C0C7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
FarsaQ8C0C7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FarsaQ8C0C7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FarsaQ8C0C7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FarsaQ8C0C7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FarsaQ8C0C7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FarsaQ8C0C7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FarsaQ8C0C7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FarsaQ8C0C7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FarsaQ8C0C7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FarsaQ8C0C7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FarsaQ8C0C7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FarsaQ8C0C7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FarsaQ8C0C7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FarsaQ8C0C7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FarsaQ8C0C7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FarsaQ8C0C7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FarsaQ8C0C7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FarsaQ8C0C7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FarsaQ8C0C7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FarsaQ8C0C7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FarsaQ8C0C7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FarsaQ8C0C7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FarsaQ8C0C7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FarsaQ8C0C7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FarsaQ8C0C7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FarsaQ8C0C7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FarsaQ8C0C7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FarsaQ8C0C7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FarsaQ8C0C7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FarsaQ8C0C7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FarsaQ8C0C7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FarsaQ8C0C7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FarsaQ8C0C7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FarsaQ8C0C7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FarsaQ8C0C7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FarsaQ8C0C7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FarsaQ8C0C7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
FarsaQ8C0C7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FarsaQ8C0C7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FarsaQ8C0C7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FarsaQ8C0C7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FarsaQ8C0C7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms