Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYK4

Rdh12, Retinol dehydrogenase 12, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh12Q8BYK4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rdh12Q8BYK4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rdh12Q8BYK4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rdh12Q8BYK4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rdh12Q8BYK4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rdh12Q8BYK4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rdh12Q8BYK4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rdh12Q8BYK4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rdh12Q8BYK4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rdh12Q8BYK4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rdh12Q8BYK4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rdh12Q8BYK4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rdh12Q8BYK4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rdh12Q8BYK4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rdh12Q8BYK4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rdh12Q8BYK4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rdh12Q8BYK4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rdh12Q8BYK4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rdh12Q8BYK4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rdh12Q8BYK4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rdh12Q8BYK4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rdh12Q8BYK4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rdh12Q8BYK4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rdh12Q8BYK4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rdh12Q8BYK4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rdh12Q8BYK4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rdh12Q8BYK4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rdh12Q8BYK4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rdh12Q8BYK4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rdh12Q8BYK4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rdh12Q8BYK4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rdh12Q8BYK4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rdh12Q8BYK4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Rdh12Q8BYK4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rdh12Q8BYK4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rdh12Q8BYK4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Rdh12Q8BYK4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rdh12Q8BYK4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Rdh12Q8BYK4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Rdh12Q8BYK4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rdh12Q8BYK4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rdh12Q8BYK4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rdh12Q8BYK4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rdh12Q8BYK4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rdh12Q8BYK4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rdh12Q8BYK4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rdh12Q8BYK4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rdh12Q8BYK4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rdh12Q8BYK4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rdh12Q8BYK4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rdh12Q8BYK4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rdh12Q8BYK4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rdh12Q8BYK4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rdh12Q8BYK4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Rdh12Q8BYK4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rdh12Q8BYK4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Rdh12Q8BYK4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rdh12Q8BYK4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rdh12Q8BYK4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rdh12Q8BYK4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rdh12Q8BYK4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rdh12Q8BYK4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rdh12Q8BYK4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Rdh12Q8BYK4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rdh12Q8BYK4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rdh12Q8BYK4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rdh12Q8BYK4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rdh12Q8BYK4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rdh12Q8BYK4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rdh12Q8BYK4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rdh12Q8BYK4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rdh12Q8BYK4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rdh12Q8BYK4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rdh12Q8BYK4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rdh12Q8BYK4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rdh12Q8BYK4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rdh12Q8BYK4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rdh12Q8BYK4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rdh12Q8BYK4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rdh12Q8BYK4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rdh12Q8BYK4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rdh12Q8BYK4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rdh12Q8BYK4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rdh12Q8BYK4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rdh12Q8BYK4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rdh12Q8BYK4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rdh12Q8BYK4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rdh12Q8BYK4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rdh12Q8BYK4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rdh12Q8BYK4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rdh12Q8BYK4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rdh12Q8BYK4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rdh12Q8BYK4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rdh12Q8BYK4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rdh12Q8BYK4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Rdh12Q8BYK4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rdh12Q8BYK4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rdh12Q8BYK4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rdh12Q8BYK4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rdh12Q8BYK4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms