Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY02

Nkrf, NF-kappa-B-repressing factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NkrfQ8BY02 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NkrfQ8BY02 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NkrfQ8BY02 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NkrfQ8BY02 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NkrfQ8BY02 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NkrfQ8BY02 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NkrfQ8BY02 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NkrfQ8BY02 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NkrfQ8BY02 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NkrfQ8BY02 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NkrfQ8BY02 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NkrfQ8BY02 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NkrfQ8BY02 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NkrfQ8BY02 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NkrfQ8BY02 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NkrfQ8BY02 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NkrfQ8BY02 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NkrfQ8BY02 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NkrfQ8BY02 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NkrfQ8BY02 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NkrfQ8BY02 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NkrfQ8BY02 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NkrfQ8BY02 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NkrfQ8BY02 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NkrfQ8BY02 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NkrfQ8BY02 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NkrfQ8BY02 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NkrfQ8BY02 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NkrfQ8BY02 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NkrfQ8BY02 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NkrfQ8BY02 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NkrfQ8BY02 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NkrfQ8BY02 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NkrfQ8BY02 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NkrfQ8BY02 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NkrfQ8BY02 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NkrfQ8BY02 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NkrfQ8BY02 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NkrfQ8BY02 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NkrfQ8BY02 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NkrfQ8BY02 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NkrfQ8BY02 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NkrfQ8BY02 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NkrfQ8BY02 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NkrfQ8BY02 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NkrfQ8BY02 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NkrfQ8BY02 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NkrfQ8BY02 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NkrfQ8BY02 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NkrfQ8BY02 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NkrfQ8BY02 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NkrfQ8BY02 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NkrfQ8BY02 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NkrfQ8BY02 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NkrfQ8BY02 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NkrfQ8BY02 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NkrfQ8BY02 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NkrfQ8BY02 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NkrfQ8BY02 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NkrfQ8BY02 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NkrfQ8BY02 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NkrfQ8BY02 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NkrfQ8BY02 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NkrfQ8BY02 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NkrfQ8BY02 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NkrfQ8BY02 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NkrfQ8BY02 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NkrfQ8BY02 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NkrfQ8BY02 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NkrfQ8BY02 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NkrfQ8BY02 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NkrfQ8BY02 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NkrfQ8BY02 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NkrfQ8BY02 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NkrfQ8BY02 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NkrfQ8BY02 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NkrfQ8BY02 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NkrfQ8BY02 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NkrfQ8BY02 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NkrfQ8BY02 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NkrfQ8BY02 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NkrfQ8BY02 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NkrfQ8BY02 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NkrfQ8BY02 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NkrfQ8BY02 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NkrfQ8BY02 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NkrfQ8BY02 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NkrfQ8BY02 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NkrfQ8BY02 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NkrfQ8BY02 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NkrfQ8BY02 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NkrfQ8BY02 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NkrfQ8BY02 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NkrfQ8BY02 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NkrfQ8BY02 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NkrfQ8BY02 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NkrfQ8BY02 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NkrfQ8BY02 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NkrfQ8BY02 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NkrfQ8BY02 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms