Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTQ0

PcgF3, Polycomb group RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcgF3Q8BTQ0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PcgF3Q8BTQ0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PcgF3Q8BTQ0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PcgF3Q8BTQ0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PcgF3Q8BTQ0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PcgF3Q8BTQ0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PcgF3Q8BTQ0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PcgF3Q8BTQ0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PcgF3Q8BTQ0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PcgF3Q8BTQ0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PcgF3Q8BTQ0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PcgF3Q8BTQ0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PcgF3Q8BTQ0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PcgF3Q8BTQ0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PcgF3Q8BTQ0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PcgF3Q8BTQ0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PcgF3Q8BTQ0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PcgF3Q8BTQ0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PcgF3Q8BTQ0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PcgF3Q8BTQ0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PcgF3Q8BTQ0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PcgF3Q8BTQ0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PcgF3Q8BTQ0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PcgF3Q8BTQ0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PcgF3Q8BTQ0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PcgF3Q8BTQ0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PcgF3Q8BTQ0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PcgF3Q8BTQ0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PcgF3Q8BTQ0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PcgF3Q8BTQ0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PcgF3Q8BTQ0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PcgF3Q8BTQ0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PcgF3Q8BTQ0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PcgF3Q8BTQ0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PcgF3Q8BTQ0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PcgF3Q8BTQ0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PcgF3Q8BTQ0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PcgF3Q8BTQ0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PcgF3Q8BTQ0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PcgF3Q8BTQ0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PcgF3Q8BTQ0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PcgF3Q8BTQ0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PcgF3Q8BTQ0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PcgF3Q8BTQ0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PcgF3Q8BTQ0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PcgF3Q8BTQ0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PcgF3Q8BTQ0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PcgF3Q8BTQ0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PcgF3Q8BTQ0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PcgF3Q8BTQ0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PcgF3Q8BTQ0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PcgF3Q8BTQ0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PcgF3Q8BTQ0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PcgF3Q8BTQ0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PcgF3Q8BTQ0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PcgF3Q8BTQ0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PcgF3Q8BTQ0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PcgF3Q8BTQ0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PcgF3Q8BTQ0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PcgF3Q8BTQ0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PcgF3Q8BTQ0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PcgF3Q8BTQ0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PcgF3Q8BTQ0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PcgF3Q8BTQ0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PcgF3Q8BTQ0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PcgF3Q8BTQ0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PcgF3Q8BTQ0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PcgF3Q8BTQ0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PcgF3Q8BTQ0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PcgF3Q8BTQ0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PcgF3Q8BTQ0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PcgF3Q8BTQ0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PcgF3Q8BTQ0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PcgF3Q8BTQ0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PcgF3Q8BTQ0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PcgF3Q8BTQ0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PcgF3Q8BTQ0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PcgF3Q8BTQ0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PcgF3Q8BTQ0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PcgF3Q8BTQ0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PcgF3Q8BTQ0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PcgF3Q8BTQ0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PcgF3Q8BTQ0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PcgF3Q8BTQ0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PcgF3Q8BTQ0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PcgF3Q8BTQ0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PcgF3Q8BTQ0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PcgF3Q8BTQ0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PcgF3Q8BTQ0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PcgF3Q8BTQ0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PcgF3Q8BTQ0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PcgF3Q8BTQ0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PcgF3Q8BTQ0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PcgF3Q8BTQ0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PcgF3Q8BTQ0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PcgF3Q8BTQ0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PcgF3Q8BTQ0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PcgF3Q8BTQ0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PcgF3Q8BTQ0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PcgF3Q8BTQ0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms