Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSK8

Rps6kb1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6kb1Q8BSK8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rps6kb1Q8BSK8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rps6kb1Q8BSK8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rps6kb1Q8BSK8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rps6kb1Q8BSK8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rps6kb1Q8BSK8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rps6kb1Q8BSK8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rps6kb1Q8BSK8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rps6kb1Q8BSK8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rps6kb1Q8BSK8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rps6kb1Q8BSK8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rps6kb1Q8BSK8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rps6kb1Q8BSK8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rps6kb1Q8BSK8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rps6kb1Q8BSK8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rps6kb1Q8BSK8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rps6kb1Q8BSK8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rps6kb1Q8BSK8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rps6kb1Q8BSK8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rps6kb1Q8BSK8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Rps6kb1Q8BSK8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
Rps6kb1Q8BSK8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rps6kb1Q8BSK8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rps6kb1Q8BSK8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Rps6kb1Q8BSK8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rps6kb1Q8BSK8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rps6kb1Q8BSK8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rps6kb1Q8BSK8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Rps6kb1Q8BSK8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rps6kb1Q8BSK8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rps6kb1Q8BSK8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Rps6kb1Q8BSK8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rps6kb1Q8BSK8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rps6kb1Q8BSK8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rps6kb1Q8BSK8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rps6kb1Q8BSK8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rps6kb1Q8BSK8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rps6kb1Q8BSK8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rps6kb1Q8BSK8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rps6kb1Q8BSK8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rps6kb1Q8BSK8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rps6kb1Q8BSK8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rps6kb1Q8BSK8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rps6kb1Q8BSK8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rps6kb1Q8BSK8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Rps6kb1Q8BSK8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rps6kb1Q8BSK8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rps6kb1Q8BSK8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Rps6kb1Q8BSK8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rps6kb1Q8BSK8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rps6kb1Q8BSK8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Rps6kb1Q8BSK8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rps6kb1Q8BSK8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rps6kb1Q8BSK8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rps6kb1Q8BSK8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rps6kb1Q8BSK8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rps6kb1Q8BSK8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rps6kb1Q8BSK8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rps6kb1Q8BSK8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rps6kb1Q8BSK8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rps6kb1Q8BSK8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rps6kb1Q8BSK8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rps6kb1Q8BSK8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rps6kb1Q8BSK8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rps6kb1Q8BSK8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rps6kb1Q8BSK8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rps6kb1Q8BSK8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rps6kb1Q8BSK8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Rps6kb1Q8BSK8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rps6kb1Q8BSK8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rps6kb1Q8BSK8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rps6kb1Q8BSK8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rps6kb1Q8BSK8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rps6kb1Q8BSK8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rps6kb1Q8BSK8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rps6kb1Q8BSK8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rps6kb1Q8BSK8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rps6kb1Q8BSK8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rps6kb1Q8BSK8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rps6kb1Q8BSK8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rps6kb1Q8BSK8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rps6kb1Q8BSK8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rps6kb1Q8BSK8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rps6kb1Q8BSK8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rps6kb1Q8BSK8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rps6kb1Q8BSK8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rps6kb1Q8BSK8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rps6kb1Q8BSK8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rps6kb1Q8BSK8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rps6kb1Q8BSK8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rps6kb1Q8BSK8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rps6kb1Q8BSK8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rps6kb1Q8BSK8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rps6kb1Q8BSK8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rps6kb1Q8BSK8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rps6kb1Q8BSK8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rps6kb1Q8BSK8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rps6kb1Q8BSK8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rps6kb1Q8BSK8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rps6kb1Q8BSK8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms