Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQZ8

Kcns3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns3Q8BQZ8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcns3Q8BQZ8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcns3Q8BQZ8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcns3Q8BQZ8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcns3Q8BQZ8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcns3Q8BQZ8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcns3Q8BQZ8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcns3Q8BQZ8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcns3Q8BQZ8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcns3Q8BQZ8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcns3Q8BQZ8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcns3Q8BQZ8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcns3Q8BQZ8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcns3Q8BQZ8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcns3Q8BQZ8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcns3Q8BQZ8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcns3Q8BQZ8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcns3Q8BQZ8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcns3Q8BQZ8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcns3Q8BQZ8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Kcns3Q8BQZ8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcns3Q8BQZ8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcns3Q8BQZ8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcns3Q8BQZ8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcns3Q8BQZ8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcns3Q8BQZ8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcns3Q8BQZ8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcns3Q8BQZ8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcns3Q8BQZ8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcns3Q8BQZ8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcns3Q8BQZ8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcns3Q8BQZ8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcns3Q8BQZ8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcns3Q8BQZ8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcns3Q8BQZ8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcns3Q8BQZ8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcns3Q8BQZ8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcns3Q8BQZ8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcns3Q8BQZ8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcns3Q8BQZ8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcns3Q8BQZ8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcns3Q8BQZ8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcns3Q8BQZ8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcns3Q8BQZ8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcns3Q8BQZ8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcns3Q8BQZ8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcns3Q8BQZ8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcns3Q8BQZ8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcns3Q8BQZ8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcns3Q8BQZ8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcns3Q8BQZ8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcns3Q8BQZ8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcns3Q8BQZ8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcns3Q8BQZ8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcns3Q8BQZ8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcns3Q8BQZ8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcns3Q8BQZ8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Kcns3Q8BQZ8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Kcns3Q8BQZ8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Kcns3Q8BQZ8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kcns3Q8BQZ8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kcns3Q8BQZ8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kcns3Q8BQZ8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcns3Q8BQZ8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcns3Q8BQZ8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcns3Q8BQZ8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcns3Q8BQZ8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcns3Q8BQZ8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcns3Q8BQZ8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcns3Q8BQZ8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcns3Q8BQZ8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcns3Q8BQZ8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcns3Q8BQZ8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcns3Q8BQZ8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcns3Q8BQZ8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcns3Q8BQZ8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcns3Q8BQZ8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcns3Q8BQZ8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcns3Q8BQZ8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcns3Q8BQZ8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcns3Q8BQZ8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcns3Q8BQZ8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcns3Q8BQZ8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcns3Q8BQZ8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcns3Q8BQZ8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcns3Q8BQZ8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcns3Q8BQZ8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcns3Q8BQZ8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcns3Q8BQZ8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcns3Q8BQZ8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcns3Q8BQZ8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcns3Q8BQZ8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcns3Q8BQZ8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcns3Q8BQZ8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kcns3Q8BQZ8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kcns3Q8BQZ8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Kcns3Q8BQZ8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcns3Q8BQZ8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcns3Q8BQZ8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcns3Q8BQZ8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
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