Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP99

UPF0500 protein C1orf216 homolog, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BP99 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Q8BP99 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q8BP99 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q8BP99 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q8BP99 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q8BP99 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q8BP99 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q8BP99 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q8BP99 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q8BP99 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q8BP99 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q8BP99 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q8BP99 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q8BP99 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q8BP99 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Q8BP99 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q8BP99 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q8BP99 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q8BP99 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q8BP99 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q8BP99 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q8BP99 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q8BP99 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q8BP99 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q8BP99 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q8BP99 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q8BP99 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q8BP99 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q8BP99 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q8BP99 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q8BP99 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q8BP99 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q8BP99 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q8BP99 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q8BP99 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q8BP99 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q8BP99 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q8BP99 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q8BP99 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q8BP99 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q8BP99 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q8BP99 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q8BP99 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q8BP99 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q8BP99 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q8BP99 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Q8BP99 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Q8BP99 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q8BP99 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q8BP99 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Q8BP99 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q8BP99 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q8BP99 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q8BP99 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q8BP99 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q8BP99 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Q8BP99 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q8BP99 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q8BP99 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q8BP99 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q8BP99 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q8BP99 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q8BP99 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q8BP99 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q8BP99 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q8BP99 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q8BP99 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Q8BP99 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q8BP99 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q8BP99 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q8BP99 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q8BP99 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q8BP99 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Q8BP99 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q8BP99 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q8BP99 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q8BP99 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q8BP99 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q8BP99 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q8BP99 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q8BP99 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Q8BP99 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Q8BP99 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Q8BP99 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q8BP99 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q8BP99 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q8BP99 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q8BP99 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q8BP99 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q8BP99 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q8BP99 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q8BP99 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q8BP99 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q8BP99 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q8BP99 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q8BP99 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q8BP99 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q8BP99 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q8BP99 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q8BP99 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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