Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMJ7

Cgrrf1, Cell growth regulator with RING finger domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cgrrf1Q8BMJ7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cgrrf1Q8BMJ7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cgrrf1Q8BMJ7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cgrrf1Q8BMJ7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cgrrf1Q8BMJ7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cgrrf1Q8BMJ7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cgrrf1Q8BMJ7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cgrrf1Q8BMJ7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cgrrf1Q8BMJ7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cgrrf1Q8BMJ7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cgrrf1Q8BMJ7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cgrrf1Q8BMJ7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cgrrf1Q8BMJ7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cgrrf1Q8BMJ7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cgrrf1Q8BMJ7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cgrrf1Q8BMJ7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cgrrf1Q8BMJ7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cgrrf1Q8BMJ7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cgrrf1Q8BMJ7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cgrrf1Q8BMJ7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cgrrf1Q8BMJ7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cgrrf1Q8BMJ7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cgrrf1Q8BMJ7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cgrrf1Q8BMJ7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cgrrf1Q8BMJ7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cgrrf1Q8BMJ7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cgrrf1Q8BMJ7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cgrrf1Q8BMJ7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cgrrf1Q8BMJ7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cgrrf1Q8BMJ7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cgrrf1Q8BMJ7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cgrrf1Q8BMJ7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cgrrf1Q8BMJ7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cgrrf1Q8BMJ7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cgrrf1Q8BMJ7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cgrrf1Q8BMJ7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cgrrf1Q8BMJ7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cgrrf1Q8BMJ7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cgrrf1Q8BMJ7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cgrrf1Q8BMJ7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cgrrf1Q8BMJ7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cgrrf1Q8BMJ7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cgrrf1Q8BMJ7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cgrrf1Q8BMJ7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cgrrf1Q8BMJ7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cgrrf1Q8BMJ7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cgrrf1Q8BMJ7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cgrrf1Q8BMJ7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cgrrf1Q8BMJ7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cgrrf1Q8BMJ7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cgrrf1Q8BMJ7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cgrrf1Q8BMJ7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cgrrf1Q8BMJ7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cgrrf1Q8BMJ7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cgrrf1Q8BMJ7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cgrrf1Q8BMJ7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cgrrf1Q8BMJ7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cgrrf1Q8BMJ7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cgrrf1Q8BMJ7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cgrrf1Q8BMJ7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cgrrf1Q8BMJ7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cgrrf1Q8BMJ7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cgrrf1Q8BMJ7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cgrrf1Q8BMJ7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cgrrf1Q8BMJ7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cgrrf1Q8BMJ7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cgrrf1Q8BMJ7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cgrrf1Q8BMJ7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cgrrf1Q8BMJ7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cgrrf1Q8BMJ7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cgrrf1Q8BMJ7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cgrrf1Q8BMJ7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cgrrf1Q8BMJ7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cgrrf1Q8BMJ7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cgrrf1Q8BMJ7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cgrrf1Q8BMJ7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cgrrf1Q8BMJ7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cgrrf1Q8BMJ7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cgrrf1Q8BMJ7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cgrrf1Q8BMJ7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cgrrf1Q8BMJ7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cgrrf1Q8BMJ7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cgrrf1Q8BMJ7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cgrrf1Q8BMJ7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cgrrf1Q8BMJ7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cgrrf1Q8BMJ7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cgrrf1Q8BMJ7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cgrrf1Q8BMJ7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cgrrf1Q8BMJ7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cgrrf1Q8BMJ7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cgrrf1Q8BMJ7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cgrrf1Q8BMJ7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cgrrf1Q8BMJ7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cgrrf1Q8BMJ7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cgrrf1Q8BMJ7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cgrrf1Q8BMJ7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cgrrf1Q8BMJ7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cgrrf1Q8BMJ7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cgrrf1Q8BMJ7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cgrrf1Q8BMJ7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms