Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLH7

Hirip3, HIRA-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hirip3Q8BLH7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Hirip3Q8BLH7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Hirip3Q8BLH7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Hirip3Q8BLH7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Hirip3Q8BLH7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Hirip3Q8BLH7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Hirip3Q8BLH7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Hirip3Q8BLH7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Hirip3Q8BLH7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Hirip3Q8BLH7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Hirip3Q8BLH7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Hirip3Q8BLH7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Hirip3Q8BLH7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Hirip3Q8BLH7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Hirip3Q8BLH7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Hirip3Q8BLH7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Hirip3Q8BLH7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Hirip3Q8BLH7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Hirip3Q8BLH7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Hirip3Q8BLH7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Hirip3Q8BLH7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Hirip3Q8BLH7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Hirip3Q8BLH7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Hirip3Q8BLH7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Hirip3Q8BLH7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Hirip3Q8BLH7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Hirip3Q8BLH7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Hirip3Q8BLH7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Hirip3Q8BLH7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Hirip3Q8BLH7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Hirip3Q8BLH7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Hirip3Q8BLH7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Hirip3Q8BLH7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Hirip3Q8BLH7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Hirip3Q8BLH7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Hirip3Q8BLH7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Hirip3Q8BLH7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Hirip3Q8BLH7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Hirip3Q8BLH7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Hirip3Q8BLH7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Hirip3Q8BLH7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Hirip3Q8BLH7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Hirip3Q8BLH7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Hirip3Q8BLH7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Hirip3Q8BLH7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Hirip3Q8BLH7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Hirip3Q8BLH7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Hirip3Q8BLH7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Hirip3Q8BLH7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Hirip3Q8BLH7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Hirip3Q8BLH7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Hirip3Q8BLH7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Hirip3Q8BLH7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Hirip3Q8BLH7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Hirip3Q8BLH7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Hirip3Q8BLH7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Hirip3Q8BLH7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hirip3Q8BLH7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hirip3Q8BLH7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hirip3Q8BLH7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hirip3Q8BLH7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Hirip3Q8BLH7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Hirip3Q8BLH7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Hirip3Q8BLH7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Hirip3Q8BLH7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Hirip3Q8BLH7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Hirip3Q8BLH7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Hirip3Q8BLH7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Hirip3Q8BLH7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Hirip3Q8BLH7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Hirip3Q8BLH7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Hirip3Q8BLH7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Hirip3Q8BLH7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Hirip3Q8BLH7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Hirip3Q8BLH7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Hirip3Q8BLH7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Hirip3Q8BLH7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Hirip3Q8BLH7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Hirip3Q8BLH7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Hirip3Q8BLH7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Hirip3Q8BLH7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Hirip3Q8BLH7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Hirip3Q8BLH7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Hirip3Q8BLH7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Hirip3Q8BLH7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Hirip3Q8BLH7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Hirip3Q8BLH7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Hirip3Q8BLH7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Hirip3Q8BLH7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Hirip3Q8BLH7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Hirip3Q8BLH7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Hirip3Q8BLH7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Hirip3Q8BLH7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Hirip3Q8BLH7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Hirip3Q8BLH7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Hirip3Q8BLH7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Hirip3Q8BLH7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Hirip3Q8BLH7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Hirip3Q8BLH7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Hirip3Q8BLH7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms