Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKN5

Tubgcp5, Gamma-tubulin complex component 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp5Q8BKN5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubgcp5Q8BKN5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubgcp5Q8BKN5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tubgcp5Q8BKN5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tubgcp5Q8BKN5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tubgcp5Q8BKN5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tubgcp5Q8BKN5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tubgcp5Q8BKN5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tubgcp5Q8BKN5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubgcp5Q8BKN5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubgcp5Q8BKN5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubgcp5Q8BKN5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubgcp5Q8BKN5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tubgcp5Q8BKN5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tubgcp5Q8BKN5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tubgcp5Q8BKN5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tubgcp5Q8BKN5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tubgcp5Q8BKN5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tubgcp5Q8BKN5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tubgcp5Q8BKN5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tubgcp5Q8BKN5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tubgcp5Q8BKN5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubgcp5Q8BKN5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubgcp5Q8BKN5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubgcp5Q8BKN5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubgcp5Q8BKN5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubgcp5Q8BKN5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubgcp5Q8BKN5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubgcp5Q8BKN5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubgcp5Q8BKN5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubgcp5Q8BKN5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubgcp5Q8BKN5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tubgcp5Q8BKN5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tubgcp5Q8BKN5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tubgcp5Q8BKN5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tubgcp5Q8BKN5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tubgcp5Q8BKN5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tubgcp5Q8BKN5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tubgcp5Q8BKN5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tubgcp5Q8BKN5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tubgcp5Q8BKN5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tubgcp5Q8BKN5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tubgcp5Q8BKN5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tubgcp5Q8BKN5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tubgcp5Q8BKN5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tubgcp5Q8BKN5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tubgcp5Q8BKN5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tubgcp5Q8BKN5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tubgcp5Q8BKN5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tubgcp5Q8BKN5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tubgcp5Q8BKN5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tubgcp5Q8BKN5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubgcp5Q8BKN5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubgcp5Q8BKN5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubgcp5Q8BKN5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubgcp5Q8BKN5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubgcp5Q8BKN5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubgcp5Q8BKN5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubgcp5Q8BKN5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubgcp5Q8BKN5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubgcp5Q8BKN5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tubgcp5Q8BKN5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tubgcp5Q8BKN5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tubgcp5Q8BKN5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tubgcp5Q8BKN5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubgcp5Q8BKN5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubgcp5Q8BKN5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubgcp5Q8BKN5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubgcp5Q8BKN5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubgcp5Q8BKN5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tubgcp5Q8BKN5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tubgcp5Q8BKN5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tubgcp5Q8BKN5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tubgcp5Q8BKN5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tubgcp5Q8BKN5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tubgcp5Q8BKN5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubgcp5Q8BKN5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubgcp5Q8BKN5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubgcp5Q8BKN5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubgcp5Q8BKN5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubgcp5Q8BKN5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubgcp5Q8BKN5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubgcp5Q8BKN5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubgcp5Q8BKN5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubgcp5Q8BKN5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubgcp5Q8BKN5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubgcp5Q8BKN5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubgcp5Q8BKN5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubgcp5Q8BKN5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubgcp5Q8BKN5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubgcp5Q8BKN5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubgcp5Q8BKN5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubgcp5Q8BKN5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubgcp5Q8BKN5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubgcp5Q8BKN5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tubgcp5Q8BKN5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tubgcp5Q8BKN5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tubgcp5Q8BKN5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tubgcp5Q8BKN5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tubgcp5Q8BKN5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms