Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nop53Q8BK35 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nop53Q8BK35 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nop53Q8BK35 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nop53Q8BK35 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nop53Q8BK35 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nop53Q8BK35 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nop53Q8BK35 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nop53Q8BK35 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nop53Q8BK35 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nop53Q8BK35 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nop53Q8BK35 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nop53Q8BK35 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nop53Q8BK35 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nop53Q8BK35 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nop53Q8BK35 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nop53Q8BK35 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nop53Q8BK35 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nop53Q8BK35 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Nop53Q8BK35 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nop53Q8BK35 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nop53Q8BK35 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nop53Q8BK35 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nop53Q8BK35 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nop53Q8BK35 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nop53Q8BK35 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nop53Q8BK35 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nop53Q8BK35 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nop53Q8BK35 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nop53Q8BK35 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nop53Q8BK35 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nop53Q8BK35 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nop53Q8BK35 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nop53Q8BK35 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nop53Q8BK35 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nop53Q8BK35 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nop53Q8BK35 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nop53Q8BK35 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nop53Q8BK35 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nop53Q8BK35 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nop53Q8BK35 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nop53Q8BK35 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nop53Q8BK35 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nop53Q8BK35 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nop53Q8BK35 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nop53Q8BK35 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nop53Q8BK35 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nop53Q8BK35 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nop53Q8BK35 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nop53Q8BK35 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nop53Q8BK35 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nop53Q8BK35 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nop53Q8BK35 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Nop53Q8BK35 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nop53Q8BK35 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nop53Q8BK35 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nop53Q8BK35 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nop53Q8BK35 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nop53Q8BK35 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nop53Q8BK35 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nop53Q8BK35 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nop53Q8BK35 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nop53Q8BK35 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nop53Q8BK35 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nop53Q8BK35 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nop53Q8BK35 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nop53Q8BK35 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nop53Q8BK35 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nop53Q8BK35 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nop53Q8BK35 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nop53Q8BK35 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nop53Q8BK35 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nop53Q8BK35 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nop53Q8BK35 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nop53Q8BK35 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nop53Q8BK35 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nop53Q8BK35 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nop53Q8BK35 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nop53Q8BK35 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Nop53Q8BK35 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nop53Q8BK35 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nop53Q8BK35 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nop53Q8BK35 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nop53Q8BK35 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nop53Q8BK35 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nop53Q8BK35 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nop53Q8BK35 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nop53Q8BK35 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nop53Q8BK35 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nop53Q8BK35 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nop53Q8BK35 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nop53Q8BK35 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nop53Q8BK35 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nop53Q8BK35 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nop53Q8BK35 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nop53Q8BK35 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nop53Q8BK35 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nop53Q8BK35 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nop53Q8BK35 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nop53Q8BK35 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms