Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII3

D130040H23Rik, RIKEN cDNA D130040H23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130040H23RikQ8BII3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
D130040H23RikQ8BII3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
D130040H23RikQ8BII3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
D130040H23RikQ8BII3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
D130040H23RikQ8BII3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
D130040H23RikQ8BII3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
D130040H23RikQ8BII3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
D130040H23RikQ8BII3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
D130040H23RikQ8BII3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
D130040H23RikQ8BII3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
D130040H23RikQ8BII3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
D130040H23RikQ8BII3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
D130040H23RikQ8BII3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
D130040H23RikQ8BII3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
D130040H23RikQ8BII3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
D130040H23RikQ8BII3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
D130040H23RikQ8BII3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
D130040H23RikQ8BII3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
D130040H23RikQ8BII3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
D130040H23RikQ8BII3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
D130040H23RikQ8BII3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
D130040H23RikQ8BII3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
D130040H23RikQ8BII3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
D130040H23RikQ8BII3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
D130040H23RikQ8BII3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
D130040H23RikQ8BII3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
D130040H23RikQ8BII3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
D130040H23RikQ8BII3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
D130040H23RikQ8BII3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
D130040H23RikQ8BII3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
D130040H23RikQ8BII3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
D130040H23RikQ8BII3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
D130040H23RikQ8BII3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
D130040H23RikQ8BII3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
D130040H23RikQ8BII3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
D130040H23RikQ8BII3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
D130040H23RikQ8BII3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
D130040H23RikQ8BII3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
D130040H23RikQ8BII3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
D130040H23RikQ8BII3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
D130040H23RikQ8BII3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
D130040H23RikQ8BII3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
D130040H23RikQ8BII3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
D130040H23RikQ8BII3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
D130040H23RikQ8BII3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
D130040H23RikQ8BII3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
D130040H23RikQ8BII3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
D130040H23RikQ8BII3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
D130040H23RikQ8BII3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
D130040H23RikQ8BII3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
D130040H23RikQ8BII3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
D130040H23RikQ8BII3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
D130040H23RikQ8BII3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
D130040H23RikQ8BII3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
D130040H23RikQ8BII3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
D130040H23RikQ8BII3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
D130040H23RikQ8BII3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
D130040H23RikQ8BII3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
D130040H23RikQ8BII3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
D130040H23RikQ8BII3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
D130040H23RikQ8BII3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
D130040H23RikQ8BII3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
D130040H23RikQ8BII3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
D130040H23RikQ8BII3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
D130040H23RikQ8BII3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
D130040H23RikQ8BII3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
D130040H23RikQ8BII3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
D130040H23RikQ8BII3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
D130040H23RikQ8BII3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
D130040H23RikQ8BII3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
D130040H23RikQ8BII3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
D130040H23RikQ8BII3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
D130040H23RikQ8BII3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
D130040H23RikQ8BII3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
D130040H23RikQ8BII3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
D130040H23RikQ8BII3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
D130040H23RikQ8BII3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
D130040H23RikQ8BII3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
D130040H23RikQ8BII3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
D130040H23RikQ8BII3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
D130040H23RikQ8BII3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
D130040H23RikQ8BII3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
D130040H23RikQ8BII3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
D130040H23RikQ8BII3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
D130040H23RikQ8BII3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
D130040H23RikQ8BII3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
D130040H23RikQ8BII3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
D130040H23RikQ8BII3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
D130040H23RikQ8BII3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
D130040H23RikQ8BII3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
D130040H23RikQ8BII3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
D130040H23RikQ8BII3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
D130040H23RikQ8BII3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
D130040H23RikQ8BII3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
D130040H23RikQ8BII3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
D130040H23RikQ8BII3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
D130040H23RikQ8BII3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
D130040H23RikQ8BII3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
D130040H23RikQ8BII3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
D130040H23RikQ8BII3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms