Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFT6

Jmjd4, JmjC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd4Q8BFT6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Jmjd4Q8BFT6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Jmjd4Q8BFT6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Jmjd4Q8BFT6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Jmjd4Q8BFT6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Jmjd4Q8BFT6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Jmjd4Q8BFT6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Jmjd4Q8BFT6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Jmjd4Q8BFT6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Jmjd4Q8BFT6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Jmjd4Q8BFT6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Jmjd4Q8BFT6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Jmjd4Q8BFT6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Jmjd4Q8BFT6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Jmjd4Q8BFT6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Jmjd4Q8BFT6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Jmjd4Q8BFT6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Jmjd4Q8BFT6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Jmjd4Q8BFT6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Jmjd4Q8BFT6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Jmjd4Q8BFT6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Jmjd4Q8BFT6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Jmjd4Q8BFT6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Jmjd4Q8BFT6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Jmjd4Q8BFT6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Jmjd4Q8BFT6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Jmjd4Q8BFT6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Jmjd4Q8BFT6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Jmjd4Q8BFT6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Jmjd4Q8BFT6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Jmjd4Q8BFT6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Jmjd4Q8BFT6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Jmjd4Q8BFT6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Jmjd4Q8BFT6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Jmjd4Q8BFT6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Jmjd4Q8BFT6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Jmjd4Q8BFT6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Jmjd4Q8BFT6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Jmjd4Q8BFT6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Jmjd4Q8BFT6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Jmjd4Q8BFT6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Jmjd4Q8BFT6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Jmjd4Q8BFT6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Jmjd4Q8BFT6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Jmjd4Q8BFT6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Jmjd4Q8BFT6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Jmjd4Q8BFT6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Jmjd4Q8BFT6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Jmjd4Q8BFT6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Jmjd4Q8BFT6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Jmjd4Q8BFT6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Jmjd4Q8BFT6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Jmjd4Q8BFT6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Jmjd4Q8BFT6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Jmjd4Q8BFT6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Jmjd4Q8BFT6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Jmjd4Q8BFT6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Jmjd4Q8BFT6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Jmjd4Q8BFT6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Jmjd4Q8BFT6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Jmjd4Q8BFT6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Jmjd4Q8BFT6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Jmjd4Q8BFT6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Jmjd4Q8BFT6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Jmjd4Q8BFT6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Jmjd4Q8BFT6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Jmjd4Q8BFT6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Jmjd4Q8BFT6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Jmjd4Q8BFT6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Jmjd4Q8BFT6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Jmjd4Q8BFT6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Jmjd4Q8BFT6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Jmjd4Q8BFT6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Jmjd4Q8BFT6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Jmjd4Q8BFT6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Jmjd4Q8BFT6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Jmjd4Q8BFT6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Jmjd4Q8BFT6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Jmjd4Q8BFT6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Jmjd4Q8BFT6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Jmjd4Q8BFT6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Jmjd4Q8BFT6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Jmjd4Q8BFT6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Jmjd4Q8BFT6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Jmjd4Q8BFT6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Jmjd4Q8BFT6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Jmjd4Q8BFT6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Jmjd4Q8BFT6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Jmjd4Q8BFT6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Jmjd4Q8BFT6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Jmjd4Q8BFT6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Jmjd4Q8BFT6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Jmjd4Q8BFT6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Jmjd4Q8BFT6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Jmjd4Q8BFT6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Jmjd4Q8BFT6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Jmjd4Q8BFT6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Jmjd4Q8BFT6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Jmjd4Q8BFT6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Jmjd4Q8BFT6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms