Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-M10.4Q85ZW8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-M10.4Q85ZW8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
H2-M10.4Q85ZW8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
H2-M10.4Q85ZW8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
H2-M10.4Q85ZW8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
H2-M10.4Q85ZW8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
H2-M10.4Q85ZW8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
H2-M10.4Q85ZW8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
H2-M10.4Q85ZW8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
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