Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z71

Tnn, Tenascin-N, mousemouse

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnnQ80Z71 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
TnnQ80Z71 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC38.15■■■■□ 3.7
TnnQ80Z71 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
TnnQ80Z71 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC38.14■■■■□ 3.7
TnnQ80Z71 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
TnnQ80Z71 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
TnnQ80Z71 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
TnnQ80Z71 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
TnnQ80Z71 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.12■■■■□ 3.69
TnnQ80Z71 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
TnnQ80Z71 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
TnnQ80Z71 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
TnnQ80Z71 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
TnnQ80Z71 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
TnnQ80Z71 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
TnnQ80Z71 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC38.1■■■■□ 3.69
TnnQ80Z71 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
TnnQ80Z71 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
TnnQ80Z71 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
TnnQ80Z71 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
TnnQ80Z71 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
TnnQ80Z71 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
TnnQ80Z71 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
TnnQ80Z71 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
TnnQ80Z71 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
TnnQ80Z71 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
TnnQ80Z71 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
TnnQ80Z71 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
TnnQ80Z71 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
TnnQ80Z71 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC38.02■■■■□ 3.68
TnnQ80Z71 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
TnnQ80Z71 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
TnnQ80Z71 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
TnnQ80Z71 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
TnnQ80Z71 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.68
TnnQ80Z71 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.68
TnnQ80Z71 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
TnnQ80Z71 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC38■■■■□ 3.67
TnnQ80Z71 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
TnnQ80Z71 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
TnnQ80Z71 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
TnnQ80Z71 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC37.99■■■■□ 3.67
TnnQ80Z71 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
TnnQ80Z71 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
TnnQ80Z71 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
TnnQ80Z71 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
TnnQ80Z71 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
TnnQ80Z71 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
TnnQ80Z71 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
TnnQ80Z71 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
TnnQ80Z71 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
TnnQ80Z71 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
TnnQ80Z71 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
TnnQ80Z71 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
TnnQ80Z71 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
TnnQ80Z71 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
TnnQ80Z71 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
TnnQ80Z71 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
TnnQ80Z71 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
TnnQ80Z71 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
TnnQ80Z71 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
TnnQ80Z71 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
TnnQ80Z71 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
TnnQ80Z71 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
TnnQ80Z71 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
TnnQ80Z71 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
TnnQ80Z71 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
TnnQ80Z71 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC37.91■■■■□ 3.66
TnnQ80Z71 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
TnnQ80Z71 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
TnnQ80Z71 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
TnnQ80Z71 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
TnnQ80Z71 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
TnnQ80Z71 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
TnnQ80Z71 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
TnnQ80Z71 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
TnnQ80Z71 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
TnnQ80Z71 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
TnnQ80Z71 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
TnnQ80Z71 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC37.88■■■■□ 3.65
TnnQ80Z71 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
TnnQ80Z71 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
TnnQ80Z71 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
TnnQ80Z71 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
TnnQ80Z71 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
TnnQ80Z71 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
TnnQ80Z71 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
TnnQ80Z71 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
TnnQ80Z71 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
TnnQ80Z71 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
TnnQ80Z71 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
TnnQ80Z71 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
TnnQ80Z71 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
TnnQ80Z71 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
TnnQ80Z71 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
TnnQ80Z71 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
TnnQ80Z71 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
TnnQ80Z71 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
TnnQ80Z71 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
TnnQ80Z71 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms