Protein–RNA interactions for Protein: Q80WT0

Jph4, Junctophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jph4Q80WT0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Jph4Q80WT0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Jph4Q80WT0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Jph4Q80WT0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Jph4Q80WT0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Jph4Q80WT0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Jph4Q80WT0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Jph4Q80WT0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Jph4Q80WT0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
Jph4Q80WT0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Jph4Q80WT0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Jph4Q80WT0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Jph4Q80WT0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
Jph4Q80WT0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
Jph4Q80WT0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Jph4Q80WT0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Jph4Q80WT0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Jph4Q80WT0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Jph4Q80WT0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Jph4Q80WT0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Jph4Q80WT0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
Jph4Q80WT0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
Jph4Q80WT0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Jph4Q80WT0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Jph4Q80WT0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Jph4Q80WT0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Jph4Q80WT0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Jph4Q80WT0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Jph4Q80WT0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Jph4Q80WT0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Jph4Q80WT0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Jph4Q80WT0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Jph4Q80WT0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Jph4Q80WT0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Jph4Q80WT0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Jph4Q80WT0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Jph4Q80WT0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Jph4Q80WT0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Jph4Q80WT0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Jph4Q80WT0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Jph4Q80WT0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Jph4Q80WT0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Jph4Q80WT0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Jph4Q80WT0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Jph4Q80WT0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
Jph4Q80WT0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Jph4Q80WT0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Jph4Q80WT0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Jph4Q80WT0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Jph4Q80WT0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Jph4Q80WT0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Jph4Q80WT0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Jph4Q80WT0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Jph4Q80WT0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Jph4Q80WT0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Jph4Q80WT0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Jph4Q80WT0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
Jph4Q80WT0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Jph4Q80WT0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
Jph4Q80WT0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Jph4Q80WT0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Jph4Q80WT0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
Jph4Q80WT0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Jph4Q80WT0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Jph4Q80WT0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Jph4Q80WT0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Jph4Q80WT0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Jph4Q80WT0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
Jph4Q80WT0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Jph4Q80WT0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Jph4Q80WT0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
Jph4Q80WT0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Jph4Q80WT0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Jph4Q80WT0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Jph4Q80WT0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Jph4Q80WT0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Jph4Q80WT0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Jph4Q80WT0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
Jph4Q80WT0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Jph4Q80WT0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Jph4Q80WT0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Jph4Q80WT0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Jph4Q80WT0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Jph4Q80WT0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Jph4Q80WT0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Jph4Q80WT0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Jph4Q80WT0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Jph4Q80WT0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Jph4Q80WT0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Jph4Q80WT0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Jph4Q80WT0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Jph4Q80WT0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Jph4Q80WT0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Jph4Q80WT0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
Jph4Q80WT0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Jph4Q80WT0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Jph4Q80WT0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Jph4Q80WT0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Jph4Q80WT0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Jph4Q80WT0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 192.7 ms