Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ell3Q80VR2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ell3Q80VR2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ell3Q80VR2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ell3Q80VR2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ell3Q80VR2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ell3Q80VR2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ell3Q80VR2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ell3Q80VR2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ell3Q80VR2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ell3Q80VR2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ell3Q80VR2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ell3Q80VR2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ell3Q80VR2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ell3Q80VR2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ell3Q80VR2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ell3Q80VR2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ell3Q80VR2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ell3Q80VR2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ell3Q80VR2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ell3Q80VR2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ell3Q80VR2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ell3Q80VR2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ell3Q80VR2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ell3Q80VR2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ell3Q80VR2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ell3Q80VR2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ell3Q80VR2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ell3Q80VR2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ell3Q80VR2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ell3Q80VR2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ell3Q80VR2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ell3Q80VR2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ell3Q80VR2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ell3Q80VR2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ell3Q80VR2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ell3Q80VR2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ell3Q80VR2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ell3Q80VR2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ell3Q80VR2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ell3Q80VR2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ell3Q80VR2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ell3Q80VR2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ell3Q80VR2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ell3Q80VR2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ell3Q80VR2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ell3Q80VR2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ell3Q80VR2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ell3Q80VR2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ell3Q80VR2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ell3Q80VR2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ell3Q80VR2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ell3Q80VR2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ell3Q80VR2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ell3Q80VR2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ell3Q80VR2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ell3Q80VR2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ell3Q80VR2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ell3Q80VR2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ell3Q80VR2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ell3Q80VR2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ell3Q80VR2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ell3Q80VR2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ell3Q80VR2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ell3Q80VR2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ell3Q80VR2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ell3Q80VR2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ell3Q80VR2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ell3Q80VR2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ell3Q80VR2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ell3Q80VR2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ell3Q80VR2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ell3Q80VR2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ell3Q80VR2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ell3Q80VR2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ell3Q80VR2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ell3Q80VR2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ell3Q80VR2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ell3Q80VR2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ell3Q80VR2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ell3Q80VR2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ell3Q80VR2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ell3Q80VR2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ell3Q80VR2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ell3Q80VR2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ell3Q80VR2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ell3Q80VR2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ell3Q80VR2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ell3Q80VR2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ell3Q80VR2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ell3Q80VR2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ell3Q80VR2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ell3Q80VR2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ell3Q80VR2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ell3Q80VR2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ell3Q80VR2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ell3Q80VR2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ell3Q80VR2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ell3Q80VR2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ell3Q80VR2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms