Protein–RNA interactions for Protein: Q80US4

Actr5, Actin-related protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actr5Q80US4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Actr5Q80US4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Actr5Q80US4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Actr5Q80US4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Actr5Q80US4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Actr5Q80US4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Actr5Q80US4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Actr5Q80US4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Actr5Q80US4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Actr5Q80US4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Actr5Q80US4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Actr5Q80US4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Actr5Q80US4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Actr5Q80US4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Actr5Q80US4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Actr5Q80US4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Actr5Q80US4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Actr5Q80US4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Actr5Q80US4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Actr5Q80US4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Actr5Q80US4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Actr5Q80US4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Actr5Q80US4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Actr5Q80US4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Actr5Q80US4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Actr5Q80US4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Actr5Q80US4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Actr5Q80US4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Actr5Q80US4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Actr5Q80US4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Actr5Q80US4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Actr5Q80US4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Actr5Q80US4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Actr5Q80US4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Actr5Q80US4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Actr5Q80US4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Actr5Q80US4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Actr5Q80US4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Actr5Q80US4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Actr5Q80US4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Actr5Q80US4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Actr5Q80US4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Actr5Q80US4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Actr5Q80US4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Actr5Q80US4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Actr5Q80US4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Actr5Q80US4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Actr5Q80US4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Actr5Q80US4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Actr5Q80US4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Actr5Q80US4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Actr5Q80US4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Actr5Q80US4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Actr5Q80US4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Actr5Q80US4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Actr5Q80US4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Actr5Q80US4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Actr5Q80US4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Actr5Q80US4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Actr5Q80US4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Actr5Q80US4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Actr5Q80US4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Actr5Q80US4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Actr5Q80US4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Actr5Q80US4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Actr5Q80US4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Actr5Q80US4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Actr5Q80US4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Actr5Q80US4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Actr5Q80US4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Actr5Q80US4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Actr5Q80US4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Actr5Q80US4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Actr5Q80US4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Actr5Q80US4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Actr5Q80US4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Actr5Q80US4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Actr5Q80US4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Actr5Q80US4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Actr5Q80US4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Actr5Q80US4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Actr5Q80US4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Actr5Q80US4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Actr5Q80US4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Actr5Q80US4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Actr5Q80US4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Actr5Q80US4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Actr5Q80US4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Actr5Q80US4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Actr5Q80US4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Actr5Q80US4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Actr5Q80US4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Actr5Q80US4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Actr5Q80US4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Actr5Q80US4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Actr5Q80US4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Actr5Q80US4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Actr5Q80US4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Actr5Q80US4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Actr5Q80US4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms