Protein–RNA interactions for Protein: Q80UJ7

Rab3gap1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3gap1Q80UJ7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rab3gap1Q80UJ7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rab3gap1Q80UJ7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rab3gap1Q80UJ7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rab3gap1Q80UJ7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rab3gap1Q80UJ7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rab3gap1Q80UJ7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Rab3gap1Q80UJ7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Rab3gap1Q80UJ7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Rab3gap1Q80UJ7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rab3gap1Q80UJ7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Rab3gap1Q80UJ7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rab3gap1Q80UJ7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rab3gap1Q80UJ7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rab3gap1Q80UJ7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Rab3gap1Q80UJ7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rab3gap1Q80UJ7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rab3gap1Q80UJ7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rab3gap1Q80UJ7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Rab3gap1Q80UJ7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rab3gap1Q80UJ7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rab3gap1Q80UJ7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rab3gap1Q80UJ7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rab3gap1Q80UJ7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rab3gap1Q80UJ7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rab3gap1Q80UJ7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Rab3gap1Q80UJ7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rab3gap1Q80UJ7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Rab3gap1Q80UJ7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rab3gap1Q80UJ7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Rab3gap1Q80UJ7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Rab3gap1Q80UJ7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rab3gap1Q80UJ7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rab3gap1Q80UJ7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rab3gap1Q80UJ7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rab3gap1Q80UJ7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Rab3gap1Q80UJ7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Rab3gap1Q80UJ7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rab3gap1Q80UJ7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rab3gap1Q80UJ7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Rab3gap1Q80UJ7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rab3gap1Q80UJ7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Rab3gap1Q80UJ7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rab3gap1Q80UJ7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rab3gap1Q80UJ7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rab3gap1Q80UJ7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Rab3gap1Q80UJ7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Rab3gap1Q80UJ7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rab3gap1Q80UJ7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rab3gap1Q80UJ7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rab3gap1Q80UJ7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rab3gap1Q80UJ7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rab3gap1Q80UJ7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rab3gap1Q80UJ7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rab3gap1Q80UJ7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rab3gap1Q80UJ7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rab3gap1Q80UJ7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rab3gap1Q80UJ7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rab3gap1Q80UJ7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rab3gap1Q80UJ7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rab3gap1Q80UJ7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rab3gap1Q80UJ7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rab3gap1Q80UJ7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rab3gap1Q80UJ7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rab3gap1Q80UJ7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rab3gap1Q80UJ7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rab3gap1Q80UJ7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rab3gap1Q80UJ7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rab3gap1Q80UJ7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rab3gap1Q80UJ7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rab3gap1Q80UJ7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rab3gap1Q80UJ7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rab3gap1Q80UJ7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rab3gap1Q80UJ7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rab3gap1Q80UJ7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rab3gap1Q80UJ7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rab3gap1Q80UJ7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rab3gap1Q80UJ7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rab3gap1Q80UJ7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rab3gap1Q80UJ7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Rab3gap1Q80UJ7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rab3gap1Q80UJ7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rab3gap1Q80UJ7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rab3gap1Q80UJ7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Rab3gap1Q80UJ7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Rab3gap1Q80UJ7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Rab3gap1Q80UJ7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rab3gap1Q80UJ7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rab3gap1Q80UJ7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rab3gap1Q80UJ7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rab3gap1Q80UJ7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Rab3gap1Q80UJ7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rab3gap1Q80UJ7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rab3gap1Q80UJ7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rab3gap1Q80UJ7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rab3gap1Q80UJ7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rab3gap1Q80UJ7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rab3gap1Q80UJ7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rab3gap1Q80UJ7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rab3gap1Q80UJ7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms