Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Avl9Q80U56 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Avl9Q80U56 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Avl9Q80U56 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Avl9Q80U56 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Avl9Q80U56 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Avl9Q80U56 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Avl9Q80U56 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Avl9Q80U56 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Avl9Q80U56 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Avl9Q80U56 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Avl9Q80U56 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Avl9Q80U56 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Avl9Q80U56 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Avl9Q80U56 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Avl9Q80U56 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Avl9Q80U56 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Avl9Q80U56 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Avl9Q80U56 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Avl9Q80U56 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Avl9Q80U56 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Avl9Q80U56 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Avl9Q80U56 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Avl9Q80U56 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Avl9Q80U56 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Avl9Q80U56 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Avl9Q80U56 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Avl9Q80U56 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Avl9Q80U56 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Avl9Q80U56 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Avl9Q80U56 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Avl9Q80U56 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Avl9Q80U56 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Avl9Q80U56 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Avl9Q80U56 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Avl9Q80U56 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Avl9Q80U56 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Avl9Q80U56 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Avl9Q80U56 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Avl9Q80U56 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Avl9Q80U56 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Avl9Q80U56 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Avl9Q80U56 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Avl9Q80U56 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Avl9Q80U56 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Avl9Q80U56 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Avl9Q80U56 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Avl9Q80U56 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Avl9Q80U56 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Avl9Q80U56 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Avl9Q80U56 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Avl9Q80U56 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Avl9Q80U56 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Avl9Q80U56 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Avl9Q80U56 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Avl9Q80U56 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Avl9Q80U56 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Avl9Q80U56 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Avl9Q80U56 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Avl9Q80U56 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Avl9Q80U56 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Avl9Q80U56 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Avl9Q80U56 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Avl9Q80U56 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Avl9Q80U56 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Avl9Q80U56 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Avl9Q80U56 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Avl9Q80U56 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Avl9Q80U56 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Avl9Q80U56 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Avl9Q80U56 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Avl9Q80U56 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Avl9Q80U56 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Avl9Q80U56 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Avl9Q80U56 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Avl9Q80U56 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Avl9Q80U56 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Avl9Q80U56 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Avl9Q80U56 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Avl9Q80U56 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Avl9Q80U56 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Avl9Q80U56 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Avl9Q80U56 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Avl9Q80U56 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Avl9Q80U56 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Avl9Q80U56 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Avl9Q80U56 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Avl9Q80U56 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Avl9Q80U56 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Avl9Q80U56 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Avl9Q80U56 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Avl9Q80U56 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Avl9Q80U56 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Avl9Q80U56 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Avl9Q80U56 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Avl9Q80U56 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Avl9Q80U56 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Avl9Q80U56 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Avl9Q80U56 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Avl9Q80U56 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms