Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ube2q1Q7TSS2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ube2q1Q7TSS2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ube2q1Q7TSS2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ube2q1Q7TSS2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ube2q1Q7TSS2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ube2q1Q7TSS2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ube2q1Q7TSS2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ube2q1Q7TSS2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ube2q1Q7TSS2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ube2q1Q7TSS2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ube2q1Q7TSS2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ube2q1Q7TSS2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ube2q1Q7TSS2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ube2q1Q7TSS2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ube2q1Q7TSS2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ube2q1Q7TSS2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ube2q1Q7TSS2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ube2q1Q7TSS2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ube2q1Q7TSS2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ube2q1Q7TSS2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ube2q1Q7TSS2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ube2q1Q7TSS2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ube2q1Q7TSS2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ube2q1Q7TSS2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ube2q1Q7TSS2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ube2q1Q7TSS2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ube2q1Q7TSS2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ube2q1Q7TSS2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ube2q1Q7TSS2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ube2q1Q7TSS2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ube2q1Q7TSS2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ube2q1Q7TSS2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ube2q1Q7TSS2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ube2q1Q7TSS2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ube2q1Q7TSS2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ube2q1Q7TSS2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ube2q1Q7TSS2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ube2q1Q7TSS2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ube2q1Q7TSS2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ube2q1Q7TSS2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ube2q1Q7TSS2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ube2q1Q7TSS2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ube2q1Q7TSS2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ube2q1Q7TSS2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ube2q1Q7TSS2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ube2q1Q7TSS2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ube2q1Q7TSS2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ube2q1Q7TSS2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ube2q1Q7TSS2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ube2q1Q7TSS2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ube2q1Q7TSS2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ube2q1Q7TSS2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ube2q1Q7TSS2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ube2q1Q7TSS2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ube2q1Q7TSS2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ube2q1Q7TSS2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ube2q1Q7TSS2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ube2q1Q7TSS2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ube2q1Q7TSS2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ube2q1Q7TSS2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ube2q1Q7TSS2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ube2q1Q7TSS2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ube2q1Q7TSS2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ube2q1Q7TSS2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ube2q1Q7TSS2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ube2q1Q7TSS2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ube2q1Q7TSS2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ube2q1Q7TSS2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ube2q1Q7TSS2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ube2q1Q7TSS2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ube2q1Q7TSS2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ube2q1Q7TSS2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ube2q1Q7TSS2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ube2q1Q7TSS2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ube2q1Q7TSS2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ube2q1Q7TSS2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ube2q1Q7TSS2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ube2q1Q7TSS2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ube2q1Q7TSS2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ube2q1Q7TSS2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ube2q1Q7TSS2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ube2q1Q7TSS2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ube2q1Q7TSS2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ube2q1Q7TSS2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ube2q1Q7TSS2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ube2q1Q7TSS2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ube2q1Q7TSS2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ube2q1Q7TSS2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ube2q1Q7TSS2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ube2q1Q7TSS2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ube2q1Q7TSS2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ube2q1Q7TSS2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ube2q1Q7TSS2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ube2q1Q7TSS2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ube2q1Q7TSS2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ube2q1Q7TSS2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ube2q1Q7TSS2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ube2q1Q7TSS2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ube2q1Q7TSS2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms