Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH2

Phkb, Phosphorylase b kinase regulatory subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PhkbQ7TSH2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PhkbQ7TSH2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PhkbQ7TSH2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PhkbQ7TSH2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PhkbQ7TSH2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PhkbQ7TSH2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PhkbQ7TSH2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PhkbQ7TSH2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PhkbQ7TSH2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PhkbQ7TSH2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PhkbQ7TSH2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PhkbQ7TSH2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PhkbQ7TSH2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PhkbQ7TSH2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PhkbQ7TSH2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PhkbQ7TSH2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PhkbQ7TSH2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PhkbQ7TSH2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PhkbQ7TSH2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PhkbQ7TSH2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PhkbQ7TSH2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PhkbQ7TSH2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PhkbQ7TSH2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PhkbQ7TSH2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PhkbQ7TSH2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PhkbQ7TSH2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PhkbQ7TSH2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PhkbQ7TSH2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PhkbQ7TSH2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PhkbQ7TSH2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PhkbQ7TSH2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PhkbQ7TSH2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PhkbQ7TSH2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PhkbQ7TSH2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PhkbQ7TSH2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PhkbQ7TSH2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PhkbQ7TSH2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PhkbQ7TSH2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PhkbQ7TSH2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PhkbQ7TSH2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PhkbQ7TSH2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PhkbQ7TSH2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PhkbQ7TSH2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PhkbQ7TSH2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PhkbQ7TSH2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PhkbQ7TSH2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PhkbQ7TSH2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PhkbQ7TSH2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PhkbQ7TSH2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PhkbQ7TSH2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PhkbQ7TSH2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PhkbQ7TSH2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PhkbQ7TSH2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PhkbQ7TSH2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PhkbQ7TSH2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PhkbQ7TSH2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PhkbQ7TSH2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PhkbQ7TSH2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PhkbQ7TSH2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PhkbQ7TSH2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PhkbQ7TSH2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PhkbQ7TSH2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PhkbQ7TSH2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PhkbQ7TSH2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PhkbQ7TSH2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PhkbQ7TSH2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PhkbQ7TSH2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PhkbQ7TSH2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PhkbQ7TSH2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PhkbQ7TSH2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PhkbQ7TSH2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PhkbQ7TSH2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PhkbQ7TSH2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PhkbQ7TSH2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PhkbQ7TSH2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PhkbQ7TSH2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PhkbQ7TSH2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PhkbQ7TSH2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PhkbQ7TSH2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PhkbQ7TSH2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PhkbQ7TSH2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PhkbQ7TSH2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PhkbQ7TSH2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PhkbQ7TSH2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PhkbQ7TSH2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PhkbQ7TSH2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PhkbQ7TSH2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PhkbQ7TSH2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PhkbQ7TSH2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PhkbQ7TSH2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PhkbQ7TSH2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PhkbQ7TSH2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PhkbQ7TSH2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PhkbQ7TSH2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PhkbQ7TSH2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PhkbQ7TSH2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PhkbQ7TSH2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PhkbQ7TSH2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PhkbQ7TSH2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PhkbQ7TSH2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms