Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ctdp1Q7TSG2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ctdp1Q7TSG2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ctdp1Q7TSG2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ctdp1Q7TSG2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ctdp1Q7TSG2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ctdp1Q7TSG2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ctdp1Q7TSG2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ctdp1Q7TSG2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ctdp1Q7TSG2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ctdp1Q7TSG2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ctdp1Q7TSG2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ctdp1Q7TSG2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ctdp1Q7TSG2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ctdp1Q7TSG2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ctdp1Q7TSG2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ctdp1Q7TSG2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ctdp1Q7TSG2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ctdp1Q7TSG2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ctdp1Q7TSG2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ctdp1Q7TSG2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ctdp1Q7TSG2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ctdp1Q7TSG2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ctdp1Q7TSG2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ctdp1Q7TSG2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ctdp1Q7TSG2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ctdp1Q7TSG2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ctdp1Q7TSG2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ctdp1Q7TSG2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ctdp1Q7TSG2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ctdp1Q7TSG2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ctdp1Q7TSG2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ctdp1Q7TSG2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ctdp1Q7TSG2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ctdp1Q7TSG2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ctdp1Q7TSG2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ctdp1Q7TSG2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ctdp1Q7TSG2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ctdp1Q7TSG2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ctdp1Q7TSG2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ctdp1Q7TSG2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ctdp1Q7TSG2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ctdp1Q7TSG2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ctdp1Q7TSG2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ctdp1Q7TSG2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ctdp1Q7TSG2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ctdp1Q7TSG2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ctdp1Q7TSG2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ctdp1Q7TSG2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ctdp1Q7TSG2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ctdp1Q7TSG2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ctdp1Q7TSG2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ctdp1Q7TSG2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ctdp1Q7TSG2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ctdp1Q7TSG2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ctdp1Q7TSG2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ctdp1Q7TSG2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ctdp1Q7TSG2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ctdp1Q7TSG2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ctdp1Q7TSG2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ctdp1Q7TSG2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ctdp1Q7TSG2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ctdp1Q7TSG2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ctdp1Q7TSG2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ctdp1Q7TSG2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ctdp1Q7TSG2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ctdp1Q7TSG2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ctdp1Q7TSG2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ctdp1Q7TSG2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ctdp1Q7TSG2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ctdp1Q7TSG2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ctdp1Q7TSG2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ctdp1Q7TSG2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ctdp1Q7TSG2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ctdp1Q7TSG2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ctdp1Q7TSG2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ctdp1Q7TSG2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ctdp1Q7TSG2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ctdp1Q7TSG2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ctdp1Q7TSG2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ctdp1Q7TSG2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ctdp1Q7TSG2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ctdp1Q7TSG2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ctdp1Q7TSG2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ctdp1Q7TSG2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ctdp1Q7TSG2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ctdp1Q7TSG2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ctdp1Q7TSG2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ctdp1Q7TSG2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ctdp1Q7TSG2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ctdp1Q7TSG2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ctdp1Q7TSG2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ctdp1Q7TSG2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ctdp1Q7TSG2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ctdp1Q7TSG2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ctdp1Q7TSG2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ctdp1Q7TSG2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ctdp1Q7TSG2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ctdp1Q7TSG2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ctdp1Q7TSG2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms