Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNV8

Defb34, Beta-defensin 34, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb34Q7TNV8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Defb34Q7TNV8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Defb34Q7TNV8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Defb34Q7TNV8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Defb34Q7TNV8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Defb34Q7TNV8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Defb34Q7TNV8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Defb34Q7TNV8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Defb34Q7TNV8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Defb34Q7TNV8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Defb34Q7TNV8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Defb34Q7TNV8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Defb34Q7TNV8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Defb34Q7TNV8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Defb34Q7TNV8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Defb34Q7TNV8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Defb34Q7TNV8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Defb34Q7TNV8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Defb34Q7TNV8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Defb34Q7TNV8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Defb34Q7TNV8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Defb34Q7TNV8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Defb34Q7TNV8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Defb34Q7TNV8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Defb34Q7TNV8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Defb34Q7TNV8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Defb34Q7TNV8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Defb34Q7TNV8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Defb34Q7TNV8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Defb34Q7TNV8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Defb34Q7TNV8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Defb34Q7TNV8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Defb34Q7TNV8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Defb34Q7TNV8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Defb34Q7TNV8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Defb34Q7TNV8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Defb34Q7TNV8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Defb34Q7TNV8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Defb34Q7TNV8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Defb34Q7TNV8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Defb34Q7TNV8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Defb34Q7TNV8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Defb34Q7TNV8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Defb34Q7TNV8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Defb34Q7TNV8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Defb34Q7TNV8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Defb34Q7TNV8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Defb34Q7TNV8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Defb34Q7TNV8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Defb34Q7TNV8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Defb34Q7TNV8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Defb34Q7TNV8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Defb34Q7TNV8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Defb34Q7TNV8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Defb34Q7TNV8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Defb34Q7TNV8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Defb34Q7TNV8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Defb34Q7TNV8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Defb34Q7TNV8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Defb34Q7TNV8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Defb34Q7TNV8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Defb34Q7TNV8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Defb34Q7TNV8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Defb34Q7TNV8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Defb34Q7TNV8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Defb34Q7TNV8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Defb34Q7TNV8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Defb34Q7TNV8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Defb34Q7TNV8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Defb34Q7TNV8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Defb34Q7TNV8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Defb34Q7TNV8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Defb34Q7TNV8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Defb34Q7TNV8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Defb34Q7TNV8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Defb34Q7TNV8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Defb34Q7TNV8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Defb34Q7TNV8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Defb34Q7TNV8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Defb34Q7TNV8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Defb34Q7TNV8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Defb34Q7TNV8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Defb34Q7TNV8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Defb34Q7TNV8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Defb34Q7TNV8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Defb34Q7TNV8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Defb34Q7TNV8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Defb34Q7TNV8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Defb34Q7TNV8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Defb34Q7TNV8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Defb34Q7TNV8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Defb34Q7TNV8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Defb34Q7TNV8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Defb34Q7TNV8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Defb34Q7TNV8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Defb34Q7TNV8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Defb34Q7TNV8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Defb34Q7TNV8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Defb34Q7TNV8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Defb34Q7TNV8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.1 ms