Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN37

Trpm4, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm4Q7TN37 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trpm4Q7TN37 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpm4Q7TN37 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpm4Q7TN37 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpm4Q7TN37 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpm4Q7TN37 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpm4Q7TN37 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpm4Q7TN37 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpm4Q7TN37 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpm4Q7TN37 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpm4Q7TN37 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpm4Q7TN37 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpm4Q7TN37 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpm4Q7TN37 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpm4Q7TN37 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpm4Q7TN37 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpm4Q7TN37 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpm4Q7TN37 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpm4Q7TN37 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpm4Q7TN37 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpm4Q7TN37 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpm4Q7TN37 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpm4Q7TN37 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpm4Q7TN37 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpm4Q7TN37 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpm4Q7TN37 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpm4Q7TN37 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpm4Q7TN37 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trpm4Q7TN37 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trpm4Q7TN37 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trpm4Q7TN37 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trpm4Q7TN37 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trpm4Q7TN37 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trpm4Q7TN37 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trpm4Q7TN37 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trpm4Q7TN37 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trpm4Q7TN37 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpm4Q7TN37 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpm4Q7TN37 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpm4Q7TN37 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpm4Q7TN37 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpm4Q7TN37 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpm4Q7TN37 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpm4Q7TN37 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpm4Q7TN37 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpm4Q7TN37 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpm4Q7TN37 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpm4Q7TN37 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpm4Q7TN37 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpm4Q7TN37 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpm4Q7TN37 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpm4Q7TN37 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpm4Q7TN37 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpm4Q7TN37 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpm4Q7TN37 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpm4Q7TN37 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpm4Q7TN37 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpm4Q7TN37 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpm4Q7TN37 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpm4Q7TN37 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpm4Q7TN37 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpm4Q7TN37 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpm4Q7TN37 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpm4Q7TN37 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpm4Q7TN37 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpm4Q7TN37 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpm4Q7TN37 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpm4Q7TN37 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpm4Q7TN37 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpm4Q7TN37 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpm4Q7TN37 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpm4Q7TN37 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Trpm4Q7TN37 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Trpm4Q7TN37 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpm4Q7TN37 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpm4Q7TN37 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpm4Q7TN37 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpm4Q7TN37 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpm4Q7TN37 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpm4Q7TN37 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpm4Q7TN37 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpm4Q7TN37 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpm4Q7TN37 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpm4Q7TN37 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpm4Q7TN37 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpm4Q7TN37 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpm4Q7TN37 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpm4Q7TN37 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpm4Q7TN37 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpm4Q7TN37 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpm4Q7TN37 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpm4Q7TN37 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpm4Q7TN37 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpm4Q7TN37 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpm4Q7TN37 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpm4Q7TN37 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpm4Q7TN37 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpm4Q7TN37 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpm4Q7TN37 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpm4Q7TN37 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms