Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMS5

Abcg2, ATP-binding cassette sub-family G member 2, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg2Q7TMS5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcg2Q7TMS5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcg2Q7TMS5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcg2Q7TMS5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcg2Q7TMS5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcg2Q7TMS5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcg2Q7TMS5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcg2Q7TMS5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcg2Q7TMS5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcg2Q7TMS5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Abcg2Q7TMS5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Abcg2Q7TMS5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Abcg2Q7TMS5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Abcg2Q7TMS5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Abcg2Q7TMS5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Abcg2Q7TMS5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Abcg2Q7TMS5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Abcg2Q7TMS5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Abcg2Q7TMS5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Abcg2Q7TMS5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Abcg2Q7TMS5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Abcg2Q7TMS5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Abcg2Q7TMS5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Abcg2Q7TMS5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Abcg2Q7TMS5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Abcg2Q7TMS5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Abcg2Q7TMS5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Abcg2Q7TMS5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Abcg2Q7TMS5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Abcg2Q7TMS5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Abcg2Q7TMS5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Abcg2Q7TMS5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Abcg2Q7TMS5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Abcg2Q7TMS5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Abcg2Q7TMS5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Abcg2Q7TMS5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Abcg2Q7TMS5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Abcg2Q7TMS5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Abcg2Q7TMS5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Abcg2Q7TMS5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Abcg2Q7TMS5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Abcg2Q7TMS5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Abcg2Q7TMS5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Abcg2Q7TMS5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Abcg2Q7TMS5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Abcg2Q7TMS5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Abcg2Q7TMS5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Abcg2Q7TMS5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Abcg2Q7TMS5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Abcg2Q7TMS5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Abcg2Q7TMS5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Abcg2Q7TMS5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abcg2Q7TMS5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abcg2Q7TMS5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abcg2Q7TMS5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abcg2Q7TMS5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abcg2Q7TMS5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abcg2Q7TMS5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abcg2Q7TMS5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abcg2Q7TMS5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abcg2Q7TMS5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Abcg2Q7TMS5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Abcg2Q7TMS5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Abcg2Q7TMS5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Abcg2Q7TMS5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcg2Q7TMS5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcg2Q7TMS5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcg2Q7TMS5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcg2Q7TMS5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcg2Q7TMS5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Abcg2Q7TMS5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Abcg2Q7TMS5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Abcg2Q7TMS5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Abcg2Q7TMS5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Abcg2Q7TMS5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcg2Q7TMS5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcg2Q7TMS5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcg2Q7TMS5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcg2Q7TMS5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcg2Q7TMS5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcg2Q7TMS5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcg2Q7TMS5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Abcg2Q7TMS5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Abcg2Q7TMS5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abcg2Q7TMS5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abcg2Q7TMS5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abcg2Q7TMS5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Abcg2Q7TMS5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Abcg2Q7TMS5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abcg2Q7TMS5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abcg2Q7TMS5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Abcg2Q7TMS5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Abcg2Q7TMS5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abcg2Q7TMS5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abcg2Q7TMS5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abcg2Q7TMS5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abcg2Q7TMS5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abcg2Q7TMS5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abcg2Q7TMS5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abcg2Q7TMS5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms