Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Uhrf2Q7TMI3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Uhrf2Q7TMI3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Uhrf2Q7TMI3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Uhrf2Q7TMI3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Uhrf2Q7TMI3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Uhrf2Q7TMI3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Uhrf2Q7TMI3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Uhrf2Q7TMI3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Uhrf2Q7TMI3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Uhrf2Q7TMI3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Uhrf2Q7TMI3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Uhrf2Q7TMI3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Uhrf2Q7TMI3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Uhrf2Q7TMI3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Uhrf2Q7TMI3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Uhrf2Q7TMI3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Uhrf2Q7TMI3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Uhrf2Q7TMI3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Uhrf2Q7TMI3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Uhrf2Q7TMI3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Uhrf2Q7TMI3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Uhrf2Q7TMI3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Uhrf2Q7TMI3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Uhrf2Q7TMI3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Uhrf2Q7TMI3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Uhrf2Q7TMI3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Uhrf2Q7TMI3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Uhrf2Q7TMI3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Uhrf2Q7TMI3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Uhrf2Q7TMI3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Uhrf2Q7TMI3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Uhrf2Q7TMI3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Uhrf2Q7TMI3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Uhrf2Q7TMI3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Uhrf2Q7TMI3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Uhrf2Q7TMI3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Uhrf2Q7TMI3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Uhrf2Q7TMI3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Uhrf2Q7TMI3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Uhrf2Q7TMI3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Uhrf2Q7TMI3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Uhrf2Q7TMI3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Uhrf2Q7TMI3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Uhrf2Q7TMI3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Uhrf2Q7TMI3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Uhrf2Q7TMI3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Uhrf2Q7TMI3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Uhrf2Q7TMI3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Uhrf2Q7TMI3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Uhrf2Q7TMI3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Uhrf2Q7TMI3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Uhrf2Q7TMI3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Uhrf2Q7TMI3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Uhrf2Q7TMI3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Uhrf2Q7TMI3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Uhrf2Q7TMI3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Uhrf2Q7TMI3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Uhrf2Q7TMI3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Uhrf2Q7TMI3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Uhrf2Q7TMI3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Uhrf2Q7TMI3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Uhrf2Q7TMI3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Uhrf2Q7TMI3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Uhrf2Q7TMI3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Uhrf2Q7TMI3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Uhrf2Q7TMI3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Uhrf2Q7TMI3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Uhrf2Q7TMI3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Uhrf2Q7TMI3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Uhrf2Q7TMI3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Uhrf2Q7TMI3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Uhrf2Q7TMI3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Uhrf2Q7TMI3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Uhrf2Q7TMI3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Uhrf2Q7TMI3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Uhrf2Q7TMI3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Uhrf2Q7TMI3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Uhrf2Q7TMI3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Uhrf2Q7TMI3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Uhrf2Q7TMI3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Uhrf2Q7TMI3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Uhrf2Q7TMI3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Uhrf2Q7TMI3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Uhrf2Q7TMI3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Uhrf2Q7TMI3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Uhrf2Q7TMI3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Uhrf2Q7TMI3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Uhrf2Q7TMI3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Uhrf2Q7TMI3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Uhrf2Q7TMI3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Uhrf2Q7TMI3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Uhrf2Q7TMI3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Uhrf2Q7TMI3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Uhrf2Q7TMI3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Uhrf2Q7TMI3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms