Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWV7

Rpl35, 60S ribosomal protein L35, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35Q6ZWV7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rpl35Q6ZWV7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rpl35Q6ZWV7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rpl35Q6ZWV7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rpl35Q6ZWV7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rpl35Q6ZWV7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rpl35Q6ZWV7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rpl35Q6ZWV7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rpl35Q6ZWV7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Rpl35Q6ZWV7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rpl35Q6ZWV7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rpl35Q6ZWV7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rpl35Q6ZWV7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rpl35Q6ZWV7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rpl35Q6ZWV7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rpl35Q6ZWV7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rpl35Q6ZWV7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rpl35Q6ZWV7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rpl35Q6ZWV7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rpl35Q6ZWV7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rpl35Q6ZWV7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rpl35Q6ZWV7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rpl35Q6ZWV7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rpl35Q6ZWV7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rpl35Q6ZWV7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rpl35Q6ZWV7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rpl35Q6ZWV7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rpl35Q6ZWV7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rpl35Q6ZWV7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Rpl35Q6ZWV7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Rpl35Q6ZWV7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rpl35Q6ZWV7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rpl35Q6ZWV7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rpl35Q6ZWV7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rpl35Q6ZWV7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rpl35Q6ZWV7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rpl35Q6ZWV7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rpl35Q6ZWV7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rpl35Q6ZWV7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rpl35Q6ZWV7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rpl35Q6ZWV7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rpl35Q6ZWV7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rpl35Q6ZWV7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rpl35Q6ZWV7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rpl35Q6ZWV7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rpl35Q6ZWV7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rpl35Q6ZWV7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rpl35Q6ZWV7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rpl35Q6ZWV7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rpl35Q6ZWV7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rpl35Q6ZWV7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rpl35Q6ZWV7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rpl35Q6ZWV7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rpl35Q6ZWV7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rpl35Q6ZWV7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rpl35Q6ZWV7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rpl35Q6ZWV7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rpl35Q6ZWV7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rpl35Q6ZWV7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rpl35Q6ZWV7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rpl35Q6ZWV7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rpl35Q6ZWV7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rpl35Q6ZWV7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rpl35Q6ZWV7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rpl35Q6ZWV7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rpl35Q6ZWV7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rpl35Q6ZWV7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Rpl35Q6ZWV7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rpl35Q6ZWV7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpl35Q6ZWV7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpl35Q6ZWV7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpl35Q6ZWV7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpl35Q6ZWV7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpl35Q6ZWV7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpl35Q6ZWV7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpl35Q6ZWV7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpl35Q6ZWV7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpl35Q6ZWV7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpl35Q6ZWV7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpl35Q6ZWV7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpl35Q6ZWV7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpl35Q6ZWV7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpl35Q6ZWV7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpl35Q6ZWV7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpl35Q6ZWV7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpl35Q6ZWV7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpl35Q6ZWV7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpl35Q6ZWV7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpl35Q6ZWV7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpl35Q6ZWV7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpl35Q6ZWV7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpl35Q6ZWV7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpl35Q6ZWV7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpl35Q6ZWV7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpl35Q6ZWV7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpl35Q6ZWV7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rpl35Q6ZWV7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rpl35Q6ZWV7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rpl35Q6ZWV7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rpl35Q6ZWV7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms