Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.2 ms