Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Topbp1Q6ZQF0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Topbp1Q6ZQF0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Topbp1Q6ZQF0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Topbp1Q6ZQF0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Topbp1Q6ZQF0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Topbp1Q6ZQF0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Topbp1Q6ZQF0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Topbp1Q6ZQF0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Topbp1Q6ZQF0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Topbp1Q6ZQF0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Topbp1Q6ZQF0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
Topbp1Q6ZQF0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Topbp1Q6ZQF0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Topbp1Q6ZQF0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Topbp1Q6ZQF0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Topbp1Q6ZQF0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Topbp1Q6ZQF0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Topbp1Q6ZQF0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Topbp1Q6ZQF0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Topbp1Q6ZQF0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Topbp1Q6ZQF0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Topbp1Q6ZQF0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Topbp1Q6ZQF0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Topbp1Q6ZQF0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Topbp1Q6ZQF0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Topbp1Q6ZQF0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Topbp1Q6ZQF0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Topbp1Q6ZQF0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Topbp1Q6ZQF0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Topbp1Q6ZQF0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Topbp1Q6ZQF0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Topbp1Q6ZQF0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Topbp1Q6ZQF0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
Topbp1Q6ZQF0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Topbp1Q6ZQF0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Topbp1Q6ZQF0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Topbp1Q6ZQF0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Topbp1Q6ZQF0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Topbp1Q6ZQF0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Topbp1Q6ZQF0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Topbp1Q6ZQF0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Topbp1Q6ZQF0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Topbp1Q6ZQF0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Topbp1Q6ZQF0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Topbp1Q6ZQF0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
Topbp1Q6ZQF0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Topbp1Q6ZQF0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Topbp1Q6ZQF0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Topbp1Q6ZQF0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Topbp1Q6ZQF0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Topbp1Q6ZQF0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Topbp1Q6ZQF0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Topbp1Q6ZQF0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Topbp1Q6ZQF0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Topbp1Q6ZQF0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Topbp1Q6ZQF0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Topbp1Q6ZQF0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
Topbp1Q6ZQF0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC33■■■□□ 2.87
Topbp1Q6ZQF0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Topbp1Q6ZQF0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Topbp1Q6ZQF0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Topbp1Q6ZQF0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Topbp1Q6ZQF0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Topbp1Q6ZQF0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Topbp1Q6ZQF0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Topbp1Q6ZQF0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Topbp1Q6ZQF0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Topbp1Q6ZQF0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Topbp1Q6ZQF0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Topbp1Q6ZQF0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Topbp1Q6ZQF0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Topbp1Q6ZQF0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Topbp1Q6ZQF0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
Topbp1Q6ZQF0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Topbp1Q6ZQF0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Topbp1Q6ZQF0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Topbp1Q6ZQF0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Topbp1Q6ZQF0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Topbp1Q6ZQF0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Topbp1Q6ZQF0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Topbp1Q6ZQF0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
Topbp1Q6ZQF0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Topbp1Q6ZQF0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Topbp1Q6ZQF0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Topbp1Q6ZQF0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Topbp1Q6ZQF0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Topbp1Q6ZQF0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Topbp1Q6ZQF0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Topbp1Q6ZQF0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Topbp1Q6ZQF0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Topbp1Q6ZQF0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Topbp1Q6ZQF0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Topbp1Q6ZQF0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Topbp1Q6ZQF0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Topbp1Q6ZQF0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Topbp1Q6ZQF0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
Topbp1Q6ZQF0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Topbp1Q6ZQF0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Topbp1Q6ZQF0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms