Protein–RNA interactions for Protein: Q6W9L1

H2-M2, Histocompatibility 2, M region locus 2, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M2Q6W9L1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
H2-M2Q6W9L1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
H2-M2Q6W9L1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
H2-M2Q6W9L1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
H2-M2Q6W9L1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
H2-M2Q6W9L1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
H2-M2Q6W9L1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
H2-M2Q6W9L1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
H2-M2Q6W9L1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
H2-M2Q6W9L1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
H2-M2Q6W9L1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
H2-M2Q6W9L1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
H2-M2Q6W9L1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
H2-M2Q6W9L1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
H2-M2Q6W9L1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
H2-M2Q6W9L1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
H2-M2Q6W9L1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
H2-M2Q6W9L1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
H2-M2Q6W9L1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
H2-M2Q6W9L1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
H2-M2Q6W9L1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
H2-M2Q6W9L1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
H2-M2Q6W9L1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
H2-M2Q6W9L1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
H2-M2Q6W9L1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
H2-M2Q6W9L1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
H2-M2Q6W9L1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
H2-M2Q6W9L1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
H2-M2Q6W9L1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
H2-M2Q6W9L1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
H2-M2Q6W9L1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
H2-M2Q6W9L1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
H2-M2Q6W9L1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
H2-M2Q6W9L1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
H2-M2Q6W9L1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
H2-M2Q6W9L1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
H2-M2Q6W9L1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
H2-M2Q6W9L1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
H2-M2Q6W9L1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
H2-M2Q6W9L1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
H2-M2Q6W9L1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
H2-M2Q6W9L1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
H2-M2Q6W9L1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
H2-M2Q6W9L1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
H2-M2Q6W9L1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
H2-M2Q6W9L1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
H2-M2Q6W9L1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
H2-M2Q6W9L1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
H2-M2Q6W9L1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
H2-M2Q6W9L1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
H2-M2Q6W9L1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
H2-M2Q6W9L1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
H2-M2Q6W9L1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
H2-M2Q6W9L1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
H2-M2Q6W9L1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
H2-M2Q6W9L1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
H2-M2Q6W9L1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
H2-M2Q6W9L1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
H2-M2Q6W9L1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
H2-M2Q6W9L1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
H2-M2Q6W9L1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
H2-M2Q6W9L1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
H2-M2Q6W9L1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
H2-M2Q6W9L1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
H2-M2Q6W9L1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
H2-M2Q6W9L1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
H2-M2Q6W9L1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
H2-M2Q6W9L1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
H2-M2Q6W9L1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
H2-M2Q6W9L1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
H2-M2Q6W9L1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
H2-M2Q6W9L1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
H2-M2Q6W9L1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
H2-M2Q6W9L1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
H2-M2Q6W9L1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
H2-M2Q6W9L1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
H2-M2Q6W9L1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
H2-M2Q6W9L1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
H2-M2Q6W9L1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
H2-M2Q6W9L1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
H2-M2Q6W9L1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
H2-M2Q6W9L1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
H2-M2Q6W9L1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
H2-M2Q6W9L1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
H2-M2Q6W9L1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
H2-M2Q6W9L1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
H2-M2Q6W9L1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
H2-M2Q6W9L1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
H2-M2Q6W9L1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
H2-M2Q6W9L1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
H2-M2Q6W9L1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
H2-M2Q6W9L1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
H2-M2Q6W9L1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
H2-M2Q6W9L1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
H2-M2Q6W9L1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
H2-M2Q6W9L1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
H2-M2Q6W9L1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
H2-M2Q6W9L1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
H2-M2Q6W9L1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
H2-M2Q6W9L1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms