Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT8

Ccdc154, Coiled-coil domain-containing protein 154, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc154Q6RUT8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc154Q6RUT8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc154Q6RUT8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc154Q6RUT8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc154Q6RUT8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc154Q6RUT8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc154Q6RUT8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc154Q6RUT8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc154Q6RUT8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc154Q6RUT8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc154Q6RUT8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc154Q6RUT8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc154Q6RUT8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc154Q6RUT8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc154Q6RUT8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc154Q6RUT8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc154Q6RUT8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc154Q6RUT8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc154Q6RUT8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc154Q6RUT8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc154Q6RUT8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc154Q6RUT8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc154Q6RUT8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc154Q6RUT8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc154Q6RUT8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc154Q6RUT8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc154Q6RUT8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc154Q6RUT8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc154Q6RUT8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc154Q6RUT8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc154Q6RUT8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc154Q6RUT8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc154Q6RUT8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc154Q6RUT8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc154Q6RUT8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc154Q6RUT8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc154Q6RUT8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc154Q6RUT8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc154Q6RUT8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc154Q6RUT8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc154Q6RUT8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc154Q6RUT8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc154Q6RUT8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc154Q6RUT8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc154Q6RUT8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc154Q6RUT8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc154Q6RUT8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc154Q6RUT8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc154Q6RUT8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc154Q6RUT8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ccdc154Q6RUT8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc154Q6RUT8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc154Q6RUT8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc154Q6RUT8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc154Q6RUT8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc154Q6RUT8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc154Q6RUT8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc154Q6RUT8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc154Q6RUT8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc154Q6RUT8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc154Q6RUT8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc154Q6RUT8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc154Q6RUT8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc154Q6RUT8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc154Q6RUT8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc154Q6RUT8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc154Q6RUT8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc154Q6RUT8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc154Q6RUT8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc154Q6RUT8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc154Q6RUT8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc154Q6RUT8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc154Q6RUT8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc154Q6RUT8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc154Q6RUT8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc154Q6RUT8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc154Q6RUT8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc154Q6RUT8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc154Q6RUT8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc154Q6RUT8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc154Q6RUT8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc154Q6RUT8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc154Q6RUT8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc154Q6RUT8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc154Q6RUT8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc154Q6RUT8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc154Q6RUT8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc154Q6RUT8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc154Q6RUT8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc154Q6RUT8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc154Q6RUT8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc154Q6RUT8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc154Q6RUT8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc154Q6RUT8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc154Q6RUT8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc154Q6RUT8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc154Q6RUT8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc154Q6RUT8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc154Q6RUT8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc154Q6RUT8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms