Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R3

Crip3, Cysteine-rich protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crip3Q6Q6R3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Crip3Q6Q6R3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Crip3Q6Q6R3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Crip3Q6Q6R3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Crip3Q6Q6R3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Crip3Q6Q6R3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Crip3Q6Q6R3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Crip3Q6Q6R3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Crip3Q6Q6R3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Crip3Q6Q6R3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Crip3Q6Q6R3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Crip3Q6Q6R3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Crip3Q6Q6R3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Crip3Q6Q6R3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Crip3Q6Q6R3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Crip3Q6Q6R3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Crip3Q6Q6R3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Crip3Q6Q6R3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Crip3Q6Q6R3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Crip3Q6Q6R3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Crip3Q6Q6R3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Crip3Q6Q6R3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Crip3Q6Q6R3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Crip3Q6Q6R3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Crip3Q6Q6R3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Crip3Q6Q6R3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Crip3Q6Q6R3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Crip3Q6Q6R3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Crip3Q6Q6R3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Crip3Q6Q6R3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Crip3Q6Q6R3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Crip3Q6Q6R3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Crip3Q6Q6R3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Crip3Q6Q6R3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Crip3Q6Q6R3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Crip3Q6Q6R3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Crip3Q6Q6R3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Crip3Q6Q6R3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Crip3Q6Q6R3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Crip3Q6Q6R3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Crip3Q6Q6R3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Crip3Q6Q6R3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Crip3Q6Q6R3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Crip3Q6Q6R3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Crip3Q6Q6R3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Crip3Q6Q6R3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Crip3Q6Q6R3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Crip3Q6Q6R3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Crip3Q6Q6R3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Crip3Q6Q6R3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Crip3Q6Q6R3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Crip3Q6Q6R3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Crip3Q6Q6R3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Crip3Q6Q6R3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Crip3Q6Q6R3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Crip3Q6Q6R3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Crip3Q6Q6R3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Crip3Q6Q6R3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Crip3Q6Q6R3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Crip3Q6Q6R3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Crip3Q6Q6R3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Crip3Q6Q6R3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Crip3Q6Q6R3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Crip3Q6Q6R3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Crip3Q6Q6R3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Crip3Q6Q6R3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Crip3Q6Q6R3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Crip3Q6Q6R3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Crip3Q6Q6R3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Crip3Q6Q6R3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Crip3Q6Q6R3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Crip3Q6Q6R3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Crip3Q6Q6R3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Crip3Q6Q6R3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Crip3Q6Q6R3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Crip3Q6Q6R3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Crip3Q6Q6R3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Crip3Q6Q6R3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Crip3Q6Q6R3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Crip3Q6Q6R3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Crip3Q6Q6R3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Crip3Q6Q6R3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Crip3Q6Q6R3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Crip3Q6Q6R3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Crip3Q6Q6R3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Crip3Q6Q6R3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Crip3Q6Q6R3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Crip3Q6Q6R3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Crip3Q6Q6R3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Crip3Q6Q6R3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Crip3Q6Q6R3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Crip3Q6Q6R3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Crip3Q6Q6R3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Crip3Q6Q6R3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Crip3Q6Q6R3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Crip3Q6Q6R3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Crip3Q6Q6R3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Crip3Q6Q6R3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Crip3Q6Q6R3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Crip3Q6Q6R3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms