Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHZ8

Kcnip4, Kv channel-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip4Q6PHZ8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kcnip4Q6PHZ8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kcnip4Q6PHZ8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kcnip4Q6PHZ8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kcnip4Q6PHZ8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kcnip4Q6PHZ8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kcnip4Q6PHZ8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcnip4Q6PHZ8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcnip4Q6PHZ8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcnip4Q6PHZ8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcnip4Q6PHZ8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcnip4Q6PHZ8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcnip4Q6PHZ8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcnip4Q6PHZ8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcnip4Q6PHZ8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcnip4Q6PHZ8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcnip4Q6PHZ8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcnip4Q6PHZ8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcnip4Q6PHZ8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcnip4Q6PHZ8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcnip4Q6PHZ8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcnip4Q6PHZ8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcnip4Q6PHZ8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kcnip4Q6PHZ8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kcnip4Q6PHZ8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Kcnip4Q6PHZ8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Kcnip4Q6PHZ8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcnip4Q6PHZ8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcnip4Q6PHZ8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcnip4Q6PHZ8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcnip4Q6PHZ8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcnip4Q6PHZ8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcnip4Q6PHZ8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcnip4Q6PHZ8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcnip4Q6PHZ8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcnip4Q6PHZ8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcnip4Q6PHZ8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kcnip4Q6PHZ8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kcnip4Q6PHZ8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kcnip4Q6PHZ8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kcnip4Q6PHZ8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kcnip4Q6PHZ8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kcnip4Q6PHZ8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Kcnip4Q6PHZ8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kcnip4Q6PHZ8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kcnip4Q6PHZ8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Kcnip4Q6PHZ8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kcnip4Q6PHZ8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kcnip4Q6PHZ8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kcnip4Q6PHZ8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kcnip4Q6PHZ8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kcnip4Q6PHZ8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kcnip4Q6PHZ8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kcnip4Q6PHZ8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kcnip4Q6PHZ8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kcnip4Q6PHZ8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kcnip4Q6PHZ8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kcnip4Q6PHZ8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kcnip4Q6PHZ8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kcnip4Q6PHZ8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kcnip4Q6PHZ8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kcnip4Q6PHZ8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Kcnip4Q6PHZ8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kcnip4Q6PHZ8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kcnip4Q6PHZ8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kcnip4Q6PHZ8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kcnip4Q6PHZ8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kcnip4Q6PHZ8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kcnip4Q6PHZ8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kcnip4Q6PHZ8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kcnip4Q6PHZ8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kcnip4Q6PHZ8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kcnip4Q6PHZ8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Kcnip4Q6PHZ8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kcnip4Q6PHZ8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kcnip4Q6PHZ8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kcnip4Q6PHZ8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kcnip4Q6PHZ8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kcnip4Q6PHZ8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kcnip4Q6PHZ8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kcnip4Q6PHZ8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kcnip4Q6PHZ8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kcnip4Q6PHZ8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kcnip4Q6PHZ8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Kcnip4Q6PHZ8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kcnip4Q6PHZ8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kcnip4Q6PHZ8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnip4Q6PHZ8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnip4Q6PHZ8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnip4Q6PHZ8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnip4Q6PHZ8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnip4Q6PHZ8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnip4Q6PHZ8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnip4Q6PHZ8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnip4Q6PHZ8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnip4Q6PHZ8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnip4Q6PHZ8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kcnip4Q6PHZ8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kcnip4Q6PHZ8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kcnip4Q6PHZ8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms