Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF5

Bms1, BMS1 homolog, ribosome assembly protein (Yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bms1Q6PGF5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Bms1Q6PGF5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Bms1Q6PGF5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Bms1Q6PGF5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Bms1Q6PGF5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Bms1Q6PGF5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Bms1Q6PGF5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Bms1Q6PGF5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Bms1Q6PGF5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Bms1Q6PGF5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Bms1Q6PGF5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Bms1Q6PGF5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Bms1Q6PGF5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Bms1Q6PGF5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Bms1Q6PGF5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Bms1Q6PGF5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Bms1Q6PGF5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Bms1Q6PGF5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Bms1Q6PGF5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Bms1Q6PGF5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Bms1Q6PGF5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Bms1Q6PGF5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Bms1Q6PGF5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Bms1Q6PGF5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Bms1Q6PGF5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Bms1Q6PGF5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Bms1Q6PGF5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Bms1Q6PGF5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Bms1Q6PGF5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Bms1Q6PGF5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Bms1Q6PGF5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Bms1Q6PGF5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Bms1Q6PGF5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Bms1Q6PGF5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Bms1Q6PGF5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Bms1Q6PGF5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Bms1Q6PGF5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Bms1Q6PGF5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Bms1Q6PGF5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Bms1Q6PGF5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Bms1Q6PGF5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Bms1Q6PGF5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Bms1Q6PGF5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Bms1Q6PGF5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Bms1Q6PGF5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Bms1Q6PGF5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Bms1Q6PGF5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Bms1Q6PGF5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Bms1Q6PGF5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Bms1Q6PGF5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Bms1Q6PGF5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Bms1Q6PGF5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Bms1Q6PGF5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Bms1Q6PGF5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Bms1Q6PGF5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Bms1Q6PGF5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Bms1Q6PGF5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Bms1Q6PGF5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Bms1Q6PGF5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Bms1Q6PGF5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Bms1Q6PGF5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Bms1Q6PGF5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Bms1Q6PGF5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Bms1Q6PGF5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Bms1Q6PGF5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Bms1Q6PGF5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Bms1Q6PGF5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Bms1Q6PGF5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Bms1Q6PGF5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Bms1Q6PGF5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Bms1Q6PGF5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Bms1Q6PGF5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Bms1Q6PGF5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Bms1Q6PGF5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Bms1Q6PGF5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Bms1Q6PGF5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Bms1Q6PGF5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Bms1Q6PGF5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Bms1Q6PGF5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Bms1Q6PGF5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Bms1Q6PGF5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Bms1Q6PGF5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Bms1Q6PGF5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Bms1Q6PGF5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Bms1Q6PGF5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Bms1Q6PGF5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Bms1Q6PGF5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Bms1Q6PGF5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Bms1Q6PGF5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Bms1Q6PGF5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Bms1Q6PGF5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Bms1Q6PGF5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Bms1Q6PGF5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Bms1Q6PGF5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Bms1Q6PGF5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Bms1Q6PGF5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Bms1Q6PGF5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Bms1Q6PGF5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Bms1Q6PGF5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Bms1Q6PGF5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.4 ms