Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Med16Q6PGF3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Med16Q6PGF3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Med16Q6PGF3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Med16Q6PGF3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Med16Q6PGF3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Med16Q6PGF3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Med16Q6PGF3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Med16Q6PGF3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Med16Q6PGF3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Med16Q6PGF3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Med16Q6PGF3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Med16Q6PGF3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Med16Q6PGF3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Med16Q6PGF3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Med16Q6PGF3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Med16Q6PGF3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Med16Q6PGF3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Med16Q6PGF3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Med16Q6PGF3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Med16Q6PGF3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Med16Q6PGF3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Med16Q6PGF3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Med16Q6PGF3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Med16Q6PGF3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Med16Q6PGF3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Med16Q6PGF3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Med16Q6PGF3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Med16Q6PGF3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Med16Q6PGF3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Med16Q6PGF3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Med16Q6PGF3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Med16Q6PGF3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Med16Q6PGF3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Med16Q6PGF3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Med16Q6PGF3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Med16Q6PGF3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Med16Q6PGF3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Med16Q6PGF3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Med16Q6PGF3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Med16Q6PGF3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Med16Q6PGF3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Med16Q6PGF3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Med16Q6PGF3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Med16Q6PGF3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Med16Q6PGF3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Med16Q6PGF3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Med16Q6PGF3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Med16Q6PGF3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Med16Q6PGF3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Med16Q6PGF3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Med16Q6PGF3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Med16Q6PGF3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Med16Q6PGF3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Med16Q6PGF3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Med16Q6PGF3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Med16Q6PGF3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Med16Q6PGF3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Med16Q6PGF3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Med16Q6PGF3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Med16Q6PGF3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Med16Q6PGF3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Med16Q6PGF3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Med16Q6PGF3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Med16Q6PGF3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Med16Q6PGF3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Med16Q6PGF3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Med16Q6PGF3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Med16Q6PGF3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Med16Q6PGF3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Med16Q6PGF3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Med16Q6PGF3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Med16Q6PGF3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Med16Q6PGF3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Med16Q6PGF3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Med16Q6PGF3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Med16Q6PGF3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Med16Q6PGF3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Med16Q6PGF3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Med16Q6PGF3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Med16Q6PGF3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Med16Q6PGF3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Med16Q6PGF3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Med16Q6PGF3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Med16Q6PGF3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Med16Q6PGF3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Med16Q6PGF3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Med16Q6PGF3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Med16Q6PGF3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Med16Q6PGF3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Med16Q6PGF3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Med16Q6PGF3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Med16Q6PGF3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Med16Q6PGF3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Med16Q6PGF3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Med16Q6PGF3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Med16Q6PGF3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Med16Q6PGF3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Med16Q6PGF3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Med16Q6PGF3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms