Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc85bQ6PDY0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc85bQ6PDY0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc85bQ6PDY0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc85bQ6PDY0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc85bQ6PDY0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc85bQ6PDY0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc85bQ6PDY0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc85bQ6PDY0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc85bQ6PDY0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc85bQ6PDY0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc85bQ6PDY0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc85bQ6PDY0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc85bQ6PDY0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc85bQ6PDY0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc85bQ6PDY0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc85bQ6PDY0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc85bQ6PDY0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc85bQ6PDY0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc85bQ6PDY0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc85bQ6PDY0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc85bQ6PDY0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc85bQ6PDY0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc85bQ6PDY0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc85bQ6PDY0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc85bQ6PDY0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc85bQ6PDY0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc85bQ6PDY0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc85bQ6PDY0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc85bQ6PDY0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc85bQ6PDY0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc85bQ6PDY0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc85bQ6PDY0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc85bQ6PDY0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc85bQ6PDY0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc85bQ6PDY0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc85bQ6PDY0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc85bQ6PDY0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc85bQ6PDY0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc85bQ6PDY0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc85bQ6PDY0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc85bQ6PDY0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc85bQ6PDY0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc85bQ6PDY0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc85bQ6PDY0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc85bQ6PDY0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc85bQ6PDY0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc85bQ6PDY0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc85bQ6PDY0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc85bQ6PDY0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc85bQ6PDY0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc85bQ6PDY0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc85bQ6PDY0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc85bQ6PDY0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc85bQ6PDY0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc85bQ6PDY0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc85bQ6PDY0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc85bQ6PDY0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc85bQ6PDY0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc85bQ6PDY0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc85bQ6PDY0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc85bQ6PDY0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc85bQ6PDY0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc85bQ6PDY0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc85bQ6PDY0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc85bQ6PDY0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc85bQ6PDY0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc85bQ6PDY0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc85bQ6PDY0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc85bQ6PDY0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc85bQ6PDY0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc85bQ6PDY0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc85bQ6PDY0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc85bQ6PDY0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc85bQ6PDY0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc85bQ6PDY0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc85bQ6PDY0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc85bQ6PDY0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc85bQ6PDY0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc85bQ6PDY0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc85bQ6PDY0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc85bQ6PDY0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc85bQ6PDY0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc85bQ6PDY0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc85bQ6PDY0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc85bQ6PDY0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc85bQ6PDY0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc85bQ6PDY0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc85bQ6PDY0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc85bQ6PDY0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc85bQ6PDY0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc85bQ6PDY0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc85bQ6PDY0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc85bQ6PDY0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc85bQ6PDY0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc85bQ6PDY0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc85bQ6PDY0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms