Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAJ1

Bcr, Breakpoint cluster region protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcrQ6PAJ1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BcrQ6PAJ1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BcrQ6PAJ1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BcrQ6PAJ1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BcrQ6PAJ1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BcrQ6PAJ1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BcrQ6PAJ1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BcrQ6PAJ1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BcrQ6PAJ1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BcrQ6PAJ1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
BcrQ6PAJ1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BcrQ6PAJ1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BcrQ6PAJ1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BcrQ6PAJ1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BcrQ6PAJ1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BcrQ6PAJ1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BcrQ6PAJ1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BcrQ6PAJ1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BcrQ6PAJ1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BcrQ6PAJ1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BcrQ6PAJ1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BcrQ6PAJ1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BcrQ6PAJ1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BcrQ6PAJ1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BcrQ6PAJ1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BcrQ6PAJ1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BcrQ6PAJ1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BcrQ6PAJ1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BcrQ6PAJ1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BcrQ6PAJ1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BcrQ6PAJ1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BcrQ6PAJ1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BcrQ6PAJ1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BcrQ6PAJ1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
BcrQ6PAJ1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BcrQ6PAJ1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BcrQ6PAJ1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BcrQ6PAJ1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BcrQ6PAJ1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BcrQ6PAJ1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BcrQ6PAJ1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BcrQ6PAJ1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BcrQ6PAJ1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BcrQ6PAJ1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
BcrQ6PAJ1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BcrQ6PAJ1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BcrQ6PAJ1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BcrQ6PAJ1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BcrQ6PAJ1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BcrQ6PAJ1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BcrQ6PAJ1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BcrQ6PAJ1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BcrQ6PAJ1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
BcrQ6PAJ1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BcrQ6PAJ1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BcrQ6PAJ1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BcrQ6PAJ1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BcrQ6PAJ1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BcrQ6PAJ1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
BcrQ6PAJ1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BcrQ6PAJ1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BcrQ6PAJ1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BcrQ6PAJ1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BcrQ6PAJ1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BcrQ6PAJ1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BcrQ6PAJ1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BcrQ6PAJ1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BcrQ6PAJ1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BcrQ6PAJ1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BcrQ6PAJ1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BcrQ6PAJ1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BcrQ6PAJ1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BcrQ6PAJ1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BcrQ6PAJ1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BcrQ6PAJ1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BcrQ6PAJ1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BcrQ6PAJ1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BcrQ6PAJ1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BcrQ6PAJ1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
BcrQ6PAJ1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BcrQ6PAJ1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BcrQ6PAJ1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BcrQ6PAJ1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BcrQ6PAJ1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BcrQ6PAJ1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BcrQ6PAJ1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BcrQ6PAJ1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
BcrQ6PAJ1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BcrQ6PAJ1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BcrQ6PAJ1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BcrQ6PAJ1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BcrQ6PAJ1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BcrQ6PAJ1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BcrQ6PAJ1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BcrQ6PAJ1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BcrQ6PAJ1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BcrQ6PAJ1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BcrQ6PAJ1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BcrQ6PAJ1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BcrQ6PAJ1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms