Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U8

Ccdc148, Coiled-coil domain-containing protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc148Q6P5U8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc148Q6P5U8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc148Q6P5U8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc148Q6P5U8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc148Q6P5U8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc148Q6P5U8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc148Q6P5U8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc148Q6P5U8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc148Q6P5U8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc148Q6P5U8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc148Q6P5U8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc148Q6P5U8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc148Q6P5U8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc148Q6P5U8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc148Q6P5U8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc148Q6P5U8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc148Q6P5U8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc148Q6P5U8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc148Q6P5U8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc148Q6P5U8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc148Q6P5U8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc148Q6P5U8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc148Q6P5U8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc148Q6P5U8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc148Q6P5U8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc148Q6P5U8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc148Q6P5U8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc148Q6P5U8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc148Q6P5U8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc148Q6P5U8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc148Q6P5U8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc148Q6P5U8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc148Q6P5U8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc148Q6P5U8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc148Q6P5U8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc148Q6P5U8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc148Q6P5U8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc148Q6P5U8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ccdc148Q6P5U8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc148Q6P5U8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc148Q6P5U8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc148Q6P5U8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc148Q6P5U8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc148Q6P5U8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc148Q6P5U8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc148Q6P5U8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc148Q6P5U8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc148Q6P5U8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc148Q6P5U8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc148Q6P5U8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc148Q6P5U8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc148Q6P5U8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc148Q6P5U8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc148Q6P5U8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc148Q6P5U8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc148Q6P5U8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc148Q6P5U8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc148Q6P5U8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc148Q6P5U8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc148Q6P5U8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc148Q6P5U8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc148Q6P5U8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc148Q6P5U8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc148Q6P5U8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc148Q6P5U8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc148Q6P5U8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc148Q6P5U8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc148Q6P5U8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccdc148Q6P5U8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccdc148Q6P5U8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc148Q6P5U8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc148Q6P5U8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc148Q6P5U8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc148Q6P5U8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc148Q6P5U8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc148Q6P5U8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc148Q6P5U8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc148Q6P5U8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc148Q6P5U8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc148Q6P5U8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc148Q6P5U8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc148Q6P5U8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc148Q6P5U8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc148Q6P5U8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc148Q6P5U8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc148Q6P5U8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc148Q6P5U8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc148Q6P5U8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc148Q6P5U8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc148Q6P5U8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc148Q6P5U8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc148Q6P5U8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc148Q6P5U8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc148Q6P5U8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc148Q6P5U8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc148Q6P5U8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc148Q6P5U8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc148Q6P5U8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc148Q6P5U8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc148Q6P5U8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms