Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2L6

Nsd3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsd3Q6P2L6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Nsd3Q6P2L6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Nsd3Q6P2L6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Nsd3Q6P2L6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Nsd3Q6P2L6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Nsd3Q6P2L6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Nsd3Q6P2L6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Nsd3Q6P2L6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Nsd3Q6P2L6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Nsd3Q6P2L6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Nsd3Q6P2L6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Nsd3Q6P2L6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Nsd3Q6P2L6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Nsd3Q6P2L6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Nsd3Q6P2L6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Nsd3Q6P2L6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Nsd3Q6P2L6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Nsd3Q6P2L6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Nsd3Q6P2L6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Nsd3Q6P2L6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Nsd3Q6P2L6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Nsd3Q6P2L6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Nsd3Q6P2L6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Nsd3Q6P2L6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Nsd3Q6P2L6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Nsd3Q6P2L6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Nsd3Q6P2L6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Nsd3Q6P2L6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Nsd3Q6P2L6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Nsd3Q6P2L6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Nsd3Q6P2L6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Nsd3Q6P2L6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Nsd3Q6P2L6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Nsd3Q6P2L6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Nsd3Q6P2L6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Nsd3Q6P2L6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Nsd3Q6P2L6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Nsd3Q6P2L6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Nsd3Q6P2L6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Nsd3Q6P2L6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Nsd3Q6P2L6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Nsd3Q6P2L6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Nsd3Q6P2L6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Nsd3Q6P2L6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Nsd3Q6P2L6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Nsd3Q6P2L6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Nsd3Q6P2L6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Nsd3Q6P2L6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Nsd3Q6P2L6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Nsd3Q6P2L6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Nsd3Q6P2L6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Nsd3Q6P2L6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Nsd3Q6P2L6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Nsd3Q6P2L6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Nsd3Q6P2L6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Nsd3Q6P2L6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Nsd3Q6P2L6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Nsd3Q6P2L6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Nsd3Q6P2L6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Nsd3Q6P2L6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Nsd3Q6P2L6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Nsd3Q6P2L6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Nsd3Q6P2L6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Nsd3Q6P2L6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Nsd3Q6P2L6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Nsd3Q6P2L6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Nsd3Q6P2L6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Nsd3Q6P2L6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Nsd3Q6P2L6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Nsd3Q6P2L6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Nsd3Q6P2L6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Nsd3Q6P2L6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Nsd3Q6P2L6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Nsd3Q6P2L6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Nsd3Q6P2L6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Nsd3Q6P2L6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Nsd3Q6P2L6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Nsd3Q6P2L6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Nsd3Q6P2L6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Nsd3Q6P2L6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Nsd3Q6P2L6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Nsd3Q6P2L6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Nsd3Q6P2L6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Nsd3Q6P2L6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Nsd3Q6P2L6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Nsd3Q6P2L6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Nsd3Q6P2L6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Nsd3Q6P2L6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Nsd3Q6P2L6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Nsd3Q6P2L6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Nsd3Q6P2L6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Nsd3Q6P2L6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Nsd3Q6P2L6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Nsd3Q6P2L6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Nsd3Q6P2L6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Nsd3Q6P2L6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Nsd3Q6P2L6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Nsd3Q6P2L6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Nsd3Q6P2L6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Nsd3Q6P2L6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms